در ادامه واکنش ها و انتقادات ملی و بین المللی از ممنوعیت کار زنان در موسسات غیر دولتی داخلی و خارجی از سوی اداره طالبان، سازمان داکتران بدون مرز نیز این تصمیم طالبان را نکوهش کرده است. 
در یک اعلامیه سازمان داکتران بدون مرز که ناوقت روز پنج شنبه منتشر گردید آمده است که این محدودیت ها را که حذف زنان از زندگی اجتماعی در افغانستان به شمار می رود، به شدت محکوم می کند.
نماینده داکتران بدون مرز در افغانستان می گوید بیش از ۵۱ درصد کارمندان صحی این سازمان زنان هستند و ادامه فعالیت این سازمان بدون حضور کارکنان زن ناممکن است: «ما در مورد نزدیک به ۹۰۰ داکتر، ‌نرس و سایر متخصصان صحبت می کنیم که هر روز تلاش می کنند به هزاران افغان مراقبت های صحی ممکن را به وجه احسن ارائه دهند. ام اس اف نمی توانست بدون آنان فعالیت کند.»

بیشتر بخوانید: طالبان وظایف زنان را در موسسات خارجی و داخلی منع کردند
نماینده این نهاد تاکید کرده است که این دستور جدید طالبان، گام دیگر برای «حذف سیستماتیک زنان» از عرصه های عمومی است که به زیان همه تمام خواهد شد.
سازمان داکتران بدون مرز به این باور است که در کشوری که اکثر مردم آن وابسته به کمک های بشردوستانه بوده و با فقر شدید ناشی از بیکاری روز افزون مواجه اند، کارمندان زن می توانند نقش مهمی در اقتصاد این کشور به ویژه ارائه خدمات طبی و درمانی ایفا کنند.

بیشتر بخوانید: منع کار زنان؛ تعلیق فعالیت چندین سازمان بین المللی در افغانستان
این سازمان تاکید کرده است که هیچ نهادی نمی تواند بدون مشارکت زنان به نیازمندان کمک کند.
سازمان داکتران بدون مرز هشدار داده است که فرمان ممنوعیت کار زنان پیامد های منفی شدیدی بر گروه های آسیب پذیر در افغانستان به ویژه زنان و کودکان بیمار برجا خواهد گذاشت. این سازمان تصریح کرده است که ممنوعیت زنان از کار به معنای جلوگیری از دسترسی آنان به خدمات درمانی است.
نماینده این نهاد با اشاره به پیامد های این دستور العمل طالبان گفته است: «بیشتر از ۹۰ درصد کارمندان طبی ما در زایشگاه خوست زنان هستند که ماهانه، با ۱۸۰۰مورد زایمان، کمک می رسانند. اگر این پالیسی به طور کامل اجرا شود، مادران بیشتری با موانع روزافزون و شاید هم غیر قابل عبور برای خدمات قبل و پس از زایمان مواجه خواهند شد و هیچ جایی برای رفتن نخواهند داشت.»

بیشتر بخوانید: واکنش های تند به ممنوعیت کار زنان افغان در موسسات داخلی و خارجی
سازمان داکتران بدون مرز در بخشی از اعلامیه اش به کمبود داکتران و کارکنان صحی زن در افغانستان اشاره کرده و گفته است ممنوعیت تحصیل دختران از سوی طالبان وضعیت را بدتر خواهد ساخت.
نماینده این نهاد در افغانستان گفته است در صورتی که نیمی از دانشجویان بخش های صحی اجازه تحصیل را نداشته باشند روشن نیست که در آینده چه اتفاقی خواهد افتاد: «به عنوان مثال ما در ولایت خوست برای پرکردن تمام بست ها در حال حاضر با کمبود شدید متخصصان زن مواجه هستیم و ما به داکتر زن بیشتری نیاز داریم.»

 بیشتر بخوانید: ملل متحد کمک‌های خود به افغانستان را ادامه می‌دهد
طالبان پس از تسلط دوباره افغانستان در حدود ده فرمان در پیوند به محدودیت حقوق زنان در افغانستان صادر کرده اند. در گام نخست زنان را از کار در نهاد های دولتی منع کرده و دروازه های مکاتب را به روی دختران بالاتر از صنف ششم بسته کردند.
به تازگی در دو دستور جداگانه زنان و دختران را از تحصیل و کار در موسسات داخلی و خارجی ممنوع کردند.
این تصامیم تازه طالبان واکنش ها و انتقاد های تند ملی و بین المللی را بر انگیخته است. در پی این تصمیم چندین سازمان مدد رسان فعالیت های شان را در افغانستان متوقف کردند.
اما طالبان هیچ اعتنایی به این هشدار ها و انتقادات نکرده اند.