اسرائیل می‌گوید که کشتی توقیف‌شده در دریای سرخ به بندر ایلات این کشور برده می‌شود تا محموله آن مورد بازرسی دقیق‌تری قرار گیرد. قرار است این کشتی تا روز شنبه (۸ مارس/۱۷ اسفند) وارد ایلات شود و «برای شناسایی احتمالی تسلیحات و مهمات بیشتردر آن تجسس بیشتری صورت گیرد.»

سودان و گروه‌های تندرو فلسطینی مانند حماس و جهاد اسلامی هرگونه ارتباط با محموله این کشتی را تکذیب کرده‌اند.
موتی الموس، سخنگوی ارتش اسرائیل، اعلام کرده که کشتی با محموله‌ای حاوی ده‌ها موشک نوع ام ۳۰۲ (M-302) که برد آن تا ۲۰۰ کیلومتر می‌رسد در حال حاضر در آب‌های شمال بندر پورت سودان است. به گفته وی "اطلاعات آشکاری" در دست است که این کشتی از مبدا ایران حرکت کرده است.

نیروی دریایی اسرائیل این کشتی که کلوس سی (Klos-C) نام دارد را روز چهارشنبه در فاصله ۱۵۰۰ کیلومتری بندر ایلات در دریای سرخ شناسایی کرد و آن را وادار نمود که به سوی این بندر تغییر مسیر دهد.

بنا به داده‌های مقام‌های اسرائیل محموله کشتی قرار بوده در بندر پورت‌ سودان تخلیه شود و از طریق راه‌های زمینی برای گروه‌های تندرو فلسطینی در نوار غزه یا گروه‌های تروریستی در صحرای سینای مصر ارسال شود. از این دو ناحیه اغلب به جنوب اسرائیل حملات موشکی یا خمپاره‌ای صورت می‌گیرد. موشه یعلون، وزیر دفاع اسرائیل گفته است که دریافت‌کننده محموله کشتی به طور مشخص گروه جهاد اسلامی بوده است.

گردان عزالدین قسام، شاخه مسلح گروه حماس که بر نوار غزه حاکم است اعلام کرده که محموله کشتی به هیچ‌وجه ارتباطی با "مقاومت فلسطین" ندارد و "اقدام تبلیغی اسرائیل صرفا در خدمت ادامه محاصره نوار غزه و ریختن خون فلسطینی‌هاست". سودان و گروه جهاد اسلامی هم هرگونه ارتباط با قاچاق اسلحه در کشتی "کلوس سی" را تکذیب کرده‌اند.

مقام‌های اسرائیلی می‌گویند که کشتی ۱۰ روز پیش بندر عباس را ترک کرده است. خدمه این کشتی مجموعاَ ۱۷نفرند که ملیت ترک، گرجی و آذربایجانی دارند، "ولی چون از محموله اسلحه پنهان شده در زیر بار سمنت در کشتی اطلاعی نداشته‌اند، آزاد می‌شوند."

رسانه‌های اسرائیلی انتقاد می‌کنند که همزمانی شناسایی کشتی و اعلام ضبط آن توسط اسرائیل با حضور بنیامین نتانیاهو، نخست‌وزیر این کشور در آمریکا نوعی "سوداگری سیاسی" را تداعی می‌کند که هدفش فشار بر دولت آمریکا جهت اتخاذ مواضع سخت‌گیرانه‌تر در مذاکرات اتمی با ایران است. نتانیاهو در سخنرانی‌های خود در آمریکا بارها هشدار داد که "نباید در ارزیابی اهداف رهبری ایران دچار اشتباه شد." سخنگوی ارتش اسرائیل البته صرفا اقدامات تکنیکی و فنی را دلیل این همزمانی اتفاقی می‌داند.

"ارتباط با سفر نتانیاهو با آمریکا"

مقام‌های ایران نیز هرگونه ارتباط با کشتی "کلوس سی" را تکذیب کرده‌اند و ماجرا را "صحنه‌پردازی اسرائیل برای نابود کردن روند مذاکرات هسته‌ای میان ایران و گروه ۱+۵" توصیف کرده‌اند.

مرضیه افخم، سخنگوی وزارت خارجه ایران روز جمعه اعلام اسرائیل را "یک ادعای ناشیانه و یک سناریوپردازی پر از ابهام و دروغ خواند که فقط اذهان بیمار، توان سر هم کردن آنها را دارند." او افزود که این ادعاها با سفر نتانیاهو به آمریکا و اجلاس سالانه آیپک، لابی بزرگ یهودیان در ایالات متحده، بی‌ارتباط نیست.

محمدجواد ظریف، وزیر خارجه ایران که در اندونزی به سر می‌برد نیز روز جمعه با حمله به اسرائیل، ارتباط کشتی حامل سلاح با ایران را یک دروغ خواند و آن را با سفر نتانیاهو به واشنگتن مرتبط دانست: «نتانیاهو در واشنگتن است و ناگهان یک هدیه الهی برای اسرائیل می‌رسد و آنها یک کشتی ایران را با سلاح می‌گیرند. آیا این فقط یک تصادف است؟»

در همین حال، جی کارنی، سخنگوی کاخ سفید تایید کرده است که آمریکا و اسرائیل در شناسایی و ردیابی کشتی همکاری‌های اطلاعاتی و نظامی داشته‌اند. او گفته است: «ما همچنان به مقابله خود با اقدامات ثبات‌شکنانه ایران در منطقه ادامه خواهیم داد و در این راستا با متحدان و شرکای خود هماهنگی و همکاری خواهیم داشت.»