وزیر کشور جمهوری اسلامی ایران روز چهارشنبه (۸ دسامبر/ ۱۷ آذر) اعلام کرد که شورای عالی امنيت تصميماتی برای حفاظت از جان دانشمندان و برخورد با عناصر جاسوسی‌ گرفته است. به گزارش خبرگزاری ایلنا و به نقل از مصطفی محمد نجار، دستگاه‌های امنيتی و اطلاعاتی برخی عوامل ترور دانشمندان هسته‌‌ای را دستگير كرده‌اند. وی همچنین گفت "رد پای سرويس‌های امنيتی آمريكا و اسرائيل در اين جنايت آشكار است". پس از ترور دو استاد فیزیک، رئیس جمهور ایران، اعضای شورای امنیت را بخاطر انتشار نام آنها مسئول دانست.