جلال الدين حقانی يکی از مهمترين رهبران نظامی طالبان به شمار می رود که به گفتهء مقامات آمريکائی در سالهای اخير مهمترين حملات را عليه نيروهای ناتو سازماندهی کرده است. نيروهای جلال الدين حقانی يک بار نيز به جان حامد کرزای سوء قصد کرده اند. جلال الدين به اتفاق پسرش سراج الدين حقانی موفق شده اند در مناطق شمالی و جنوبی وزيرستان سازمان القاعده را در پناه خود بگيرند و مراکز تدارکاتی و اطلاعاتی مهمی برای طالبان فراهم کنند. آنها پل رابطی هستند ميان جنگندگان طالبان در پاکستان و افغانستان.

نيروی نظامی آمريکا در سومين شبيخون خود به طالبان در خاک پاکستان، روز دوشنبه (۸ سپتامبر) از داخل يک هواپيمای بی سرنشين پنج موشک به قرارگاه حقانی ها شليک کرد. بنا به گزارش نيويورک تايمز(۹ سپتامبر) به هنگام اين حمله هيچکدام از حقانی های پدر و پسر در محل حضور نداشتند اما ۲۳ تن از وابستگان آنها، از جمله هشت کودک، در اين شبيخون به قتل رسيدند.

طبق گفتهء اهالی ميرانشاه، مرکز وزيرستان، قرارگاه سراج الدين حقانی در شمال وزيرستان که مورد حمله قرار گرفت محل پذيرايی از رزمندگانی بود که نخستين بار برای جهاد به صفوف حقانی ها می پيوستند. اين رزمندگان از مناطقی چون آذربايجان، چچن و ازبکستان می آيند تا هم‌پای هم‌کيشان خود با نيروهای ناتو در افغانستان نبرد کنند. در ميان کشته شدگان شبيخون دوشنبه، دو فرماندهء طالبان با اهليت عرب و آذربايجانی وجود داشتند. پس از حمله، بدرالدين حقانی پسر جوان تر جلال الدين به خبرنگاران تلويزيون پاکستان گفته است که پدر و برادرش زنده و سالم اند.

گفتنی است که جلال الدين حقانی در دههء ۱۹۸۰ ميلادی توسط سازمان مرکزی اطلاعات آمريکا (CIA) پرورده و حمايت می شد و بنا به گزارش نيويورک تايمز، آمريکا به او دهها هزار دلار پول نقد داده بود تا با نيروهای اتحاد شوروی سابق مبارزه کند. حقانی از همان زمان اسامه بن لادن را زير چتر حمايت خود گرفت و با پشتيبانی سازمانهای امنيتی ايالات متحده به بن لادن کمک کرد تا او سازمان سياسی ـ نظامی القاعده را برای نبرد با کمونيسم بنياد گذارد.