محمدرضا خاتمی، نایب رئیس مجلس اصلاحات و یکی از چهره‌های سرشناس جنبش اصلاح‌طلبی در مصاحبه‌ای تفصیلی با روزنامه "اعتماد" که در شماره روز دوشنبه (۱۷ مهر/۸ اکتبر) منتشر شده، بر دیدگاه اصلاح‌طلبان مبنی بر حفظ اصل نظام تأکید کرده است. او گفته است که اصلاح‌طلبان "در هیچ‌زمانی برای براندازی این نظام هیچ‌گونه اقدامی نخواهند کرد و مخالف جدی آن [این اقدام] هستند."

محمدرضا خاتمی در پاسخ به سئوالی در مورد اینکه آیا در میان چهره‌ها و گروه‌های شناخته‌شده اصلاحات درباره علت مشکلات کشور وحدت نظر وجود دارد، پاسخ داده است که اصلاح‌طلبان "در اصل نظام هیچ تردیدی ندارند" و بر این باورند که "همین نظام ولایت فقیه می‌تواند یک نظام دموکراتیک باشد."

محمدرضا خاتمی که زمانی دبیرکلی جبهه مشارکت را بر عهده داشت، شرایط و فشارهای سخت بر اصلاح‌طلبان به ویژه پس از انتخابات ریاست‌جمهوری سال ۱۳۸۸ را باعث منفعل شدن و کنار نشستن آنان ندانسته، بلکه به گفته وی آنان در این مدت "هر آنچه برای اداره کشور لازم بوده، نه تنها حفظ بلکه پرورش و گسترش داده‌اند."

او ادامه داده است که به دلیل فشارهای زیاد "عموم مردم از این اقدامات اطلاعی ندارند."

نایب رئیس مجلس ششم و برادر محمد خاتمی، رئیس‌جمهور پیشین ایران، در این گفتگو روش اصلاح‌طلبان مبنی بر داشتن "صبر و حوصله" را استراتژی این گروه خوانده و آن را شرط اصلی به نتیجه رسیدن جنبش اصلاح‌طلبی نامیده زیرا به گفته‌ وی حتی اگر انقلابی در کشور رخ دهد، نتیجه آن پس از گذشت چند سال یا چند دهه همان خواهد شد که ایران اکنون با آن روبروست.

او البته تأکید کرده است که صبر در برابر شرایط موجود به معنای انتظار برای "آینده خیلی دوری" نیست.

دبیر کل پیشین جبهه مشارکت جریان اصلاحات را هم اکنون قوی‌تر از زمان اوج‌گیری این جریان در سال ۱۳۷۶ دانسته است. به باور وی مسائلی نظیر ناکارآمدی دولت به نفع اصلاح‌طلبان تمام شده و "نفوذ کلام و افزایش اعتماد عمومی" برای آنان به همراه داشته است.

او با این همه حرکت در چارچوب قانون اساسی را موضعی دانسته که تمامی اصلاح‌طلبان به طور یکپارچه بر آن توافق نظر دارند و افزوده است: «اصلاح‌طلبان تمامی تلاش‌شان را می‌کنند که این نظام را اصلاح کنند، اما اگر نظام اصلاح‌پذیر نبود و اصلاح نشد، وارد فاز دیگری نخواهند شد. ممکن است گوشه‌گیری و سکوت پیشه کنند یا به دنبال کار و زندگی خود بروند...ما پرچم براندازی را برای همیشه در جبهه اصلاح‌طلبان پایین کشیده‌ایم.»

محمدرضا خاتمی در ادامه به تلاش‌هایی اشاره کرده که برای "کشاندن اصلاح‌طلبان به براندازی" صورت گرفته و اضافه کرده است: «آقايان خيلی تلاش كردند و به ويژه در طول اين سه سال تلاش مضاعفی صورت گرفت تا اصلاح‌طلبان را به براندازی بكشانند چون می‌‌دانستند اگر اصلاح‌طلبان وارد اين فاز شوند به راحتی آب خوردن از بين خواهند رفت. اما اصلاح‌طلبان وارد اين دام نشدند.»

به گفته او اصلاح‌طلبان شدیدترین انتقادات را به نظام دارند و آنها را نیز عنوان می‌کنند اما "حاضر نیستند به همه چیز پشت پا بزنند تنها به این دلیل که یک عده خاص، این نظام را به انحراف کشانده‌اند."

دبیرکل پیشین جبهه مشارکت در مورد امکان ورود اصلاح‌طلبان با لحاظ کردن گزینه‌های حداقلی به انتخابات، پاسخ داده است که اصلاح‌طلبان همگی حضور در قدرت "به هر قیمتی را دیگر قبول ندارند."

او روش‌هایی غیر از روش انتخابات نظیر توافق کردن با حاکمیت را به شدت رد کرده و اعتقاد اصلاح‌طلبان را بر رسیدن به قدرت با "رأی مردم" استوار دانسته است.

محمدرضا خاتمی گفته است: «عده‌ای از دوستان تصور می‌‌كنند كه همه مشكلات ناشی از آقای احمدی‌‌نژاد است و اگر او برود همه‌ چيز درست می‌‌شود. البته من منكر اين نيستم كه سليقه‌ها و نحوه مديريت‌ها در كشور تاثيرات مهمی‌ دارد، اما تغيير اساسی‌ با تغيير يک رييس‌جمهور شكل نمی‌‌گيرد.»

دبیرکل پیشین جبهه مشارکت معرفی "اصلاح‌طلبان قلابی" از سوی رسانه‌های وابسته به محافل اصول‌گرا را یکی از روش‌هایی نام برده که در سه سال اخیر برای تخریب چهره‌اصلاح‌طلبان به کار برده شده که به گفته وی "نقشه آنان هم نگرفته است."

محمدرضا خاتمی نیاز به اصلاح‌طلبی در شرایط کنونی را در بیش از گذشته خوانده و گفته است: «چه آنهايی كه در درون حاكميت هستند و چه منتقدان، همه به نامناسب بودن اوضاع اعتراف دارند. اين بد بودن هم در يک زمينه نيست كه مثلا بگوييم اوضاع سياسی بد است. چون به همان ميزان كه اوضاع سياسی بد است، اوضاع اقتصادی، اجتماعی، فرهنگی هم نگران‌كننده است. به همين دليل اين سياست قابل ادامه دادن نيست و وضعيت فعلی نمی‌‌تواند دوام پيدا كند.»

در پی پیامدهای انتخابات سال ۱۳۸۸ بسیاری از چهره‌های به نام و ارشد جبهه مشارکت دستگیر شده و به زندان افکنده شدند و خود این تشکل نیز بنا به حکمی بحث‌انگیز از سوی قوه قضائیه، منحل اعلام شد.