星期五晚上，中國外交部發表聲明強調指出，中方逮捕闖入日本領事館的北北韓難民事先獲得了日本領館人員的同意。據日本共同通訊社報導，日本駐華大使館駁斥了中國外交部的這一說法。

星期六，以日本外交部領館事務處負責人為首的一個日本5人代表團抵達中國東北城市沈陽，對事件進行調查。據報導，星期三，5名北北韓人試圖闖入沈陽日本總領事館，以此達到前往韓國的目的。但是被進入日本領館的中國武警人員逮捕。

日本方面認為中國警方的行動違反了國際法，要求中方交出5名北北韓人。而中國新華通訊社發表的中國外交部聲明則強調，中國武警人員是獲得日本領館副領事的同意之後才進入日本領館的。

中國外交部發言人孔泉說，日本領館一位領事向中方瞭解了情況後，同意將5人帶走並對中國武警戰士表示感謝。中國駐東京大使館一位外交官說，中國武警人員逮捕闖入日本領館的不明身份者時，並不知道他們的身份。事後審問時才知道是尋求庇護的北北韓難民。

這位外交官強調，中國警察事先問了一位日本領事，是否可以將這些人帶走。這位日本領館工作人員同上司用手機通了電話並徵得同意。此外，中國武警人員也詢問日本領館人員是否可以走進領館大門地帶，日本一位副領事用中文表示了同意。

日本此間駁斥了中國外交部關於中國武警人員徵得日本領館人員同意逮捕北北韓難民的聲明。日本東京外交部星期六表示，日本駐沈陽領館從未同意中國武警人員逮捕5名北北韓人。日本強烈抗議中國警方闖入日本駐沈陽領館逮捕北北韓難民並要求中方對此表示道歉。