衝突真正爆發是在90年代，當時分離主義分子開始了反抗印度政府的武裝鬥爭和恐怖活動。1989年12月8日到13日，當地發生的一起綁架事件成為持續多年的流血衝突的導火索。

1989年，印控克什米爾地區的局勢躁動不安，當地居民對印度政府和安全力量的不滿達到了高峰。12月8日，克什米爾解放陣線的武裝分子綁架了印度內政部長薩易德的女兒魯拜亞。對綁架者來說，來自克什米爾，卻為印度當局效力的薩易德是個叛徒。因此在綁架事件期間，克什米爾首府斯裡納加居民的怒火針對的並不是綁架者，而是印度政府。

最後印度政府向綁架者作出了讓步，釋放了5名在押的分離主義武裝分子。12月13日，綁架者釋放了魯拜亞。

當時正在克什米爾的記者辛格回憶道：「每隔15到20米就有分離武裝的支持者向我們要錢，好去慶祝一番。這是個轉折點，之前並沒有真正的武裝抵抗，但從那以後，便一發不可收拾，5名武裝分子獲釋，使人們感覺獲得了道義上的勝利。」

克什米爾分離運動也因此受到鼓舞。當地的許多年輕人投奔克什米爾解放陣線和其它組織，參與對印度警察和軍隊的襲擊。分離運動還得到外部力量的支持，尤其是巴基斯坦支持印控克什米爾地區的的武裝鬥爭，提供金錢，武器和訓練場所。隨著時間的推移，越來越多的克什米爾人脫離了武裝鬥爭，而來自巴基斯坦和其它國家的極端分子卻前赴後繼，投入獨立鬥爭，自1989年以來已有45000到70000人在衝突中喪生。

巴基斯坦政府希望暴力活動能給印度和國際社會製造壓力，迫使各方重新討論克什米爾問題，結束該地區的分裂狀態。在巴基斯坦同印度進行的所有交涉，包括最近的和平對話中，克什米爾的未來始終是一個不變的中心議題。

巴基斯坦總統穆沙拉夫說：「毫無疑問，克什米爾問題是討論的核心。這一問題必須得到公正的解決，使印度，巴基斯坦和克什米爾三方都能夠接受。」

但暴力衝突卻在持續。克什米爾武裝分子的襲擊和印度安全力量的挑釁，幾乎每天都在發生。而受害者往往是無辜的平民。今年夏天，一枚定時炸彈在斯裡納加市中心爆炸，造成兩人死亡，20多人受傷。人們估計，安放炸彈的是分離主義武裝分子。

穆斯林極端武裝分子表示，他們在爭取獨立的鬥爭中，不會傷害及平民，但悲劇還是發生了。儘管如此，一些人仍然認為，他們的鬥爭是有理有據的。

斯裡納加分離組織中的強硬派代表吉拉尼說：「我們也反對恐怖主義。但為自由而戰完全是另外一回事。兩者的區別在於，我們是為正義的事業而鬥爭。當然，這一點不是所有人都能看清楚。我們認為，我們從事的不是恐怖活動，而是為自由而鬥爭。」

經過了15年的流血仇殺，克什米爾人已經厭倦了鬥爭。他們希望能開放邊境交通，讓他們能和停火線另一側的親友往來走動，他們希望當地飽受創傷的經濟能夠得到復甦。總之，他們希望能夠迎來和平。