至今為止，海嘯在索馬利亞造成的傷亡人數依然沒有一個明確的答案。當12月26日大浪襲來時，大部分索馬利亞漁民都在海上捕魚。根據聯合國以及一些救援組織的估計，海嘯奪取了大約200到300名索馬利亞人的性命，同時，有超過17000名當地民眾在海嘯中失去家園，這裡也需要得到緊急援助。

聯合國世界糧食計劃署的勞拉－梅羅在肯亞内羅必表示，「目前我們對海嘯在索馬利亞所造成的損失還不能做出全面的估計。我們在受災地區有救援團隊領導救援工作，並嘗試對災情做出評估。根據最新得到的訊息，當地有30000人被淹，他們失去了所有賴以生存的東西，房子，還有所有捕魚的設備。他們失去了維持生活的條件。」

索馬利亞受災最嚴重的地區是北部的邦特蘭。那裡的哈豐半島幾乎被海浪全部淹沒，只有一部分島民跑到山上，才逃離了虎口。而大部分出海的漁民都被海浪捲走了。這裡的民眾大部分以捕魚維持生計，而最大的買家是阿聯酋。海浪把這裡原本就破舊不堪的基礎設施全部摧毀，這使得救援行動更加難以展開。

「我們嘗試用最快的速度向哈豐運送救災物資，但是我們的卡車到了福阿（Foar）就無法前進了，因為所有的大路都被沖壞。而那裡離哈豐還有60到70公里。我們必須用其他車輛把那些最必須的物資送到災區。」梅羅這樣描述救災工作的艱難程度。而從福阿到哈豐雖然只有不到70公里，車輛卻需要行駛7到8個小時。

這次海嘯對於索馬利亞的漁民來說是一次巨大的打擊。最近四年來，由於缺乏食物，許多索馬利亞人改變了原先的生活方式，通過捕魚為生。突如其來的海嘯使他們頓時一無所有。

世界糧食計劃署正在嘗試用船把救災物資從肯亞港口城市蒙巴薩運送到索馬利亞北部災區，比如食品、被縟和藥品。而對於剛剛成立的政府，當地人並不能報以希望。因為目前掌權的依然是有勢力的軍閥，新近選出的流亡政府根本無法控制國內局勢。

世界糧食計劃署呼籲國際社會在關注東南亞災情的時候，不要忘記東非的難民們。梅羅表示，「在接下來的六個月裡，我們急需大約280萬美元的援助，以維持索馬利亞海嘯難民的生活。」