「按照設想，南水北調可以挽救北方的經濟。但環保人士擔心，如果世界第三大河的長江抽水過多，將嚴重破壞生態平衡。其它河流和湖泊無法保有足夠水量，海水可能倒灌進入長江三角洲。

「批評人士對工程最終是否劃得來也表示懷疑。運送每立方米水的費用為二到三元人民幣，電力消耗巨大，僅東線的水泵一天就要消耗七百萬千瓦時的電力。

「此外，渠道、管道和水泵必須不斷維修和保護。輸水量也許只有一半能到達北方，另一半在途中流失、蒸發或被農民引走自用。能否成功地淨化水源也是擔心之一，僅江蘇省就計劃建26個污水處理站，但經驗證明，污水處理站並非總能有效地運轉。」