「選舉結果再次表明，一道深深裂痕把島上近2300萬居民分割開了。這裡並非關係到台灣的經濟發展走向和內政問題，更多涉及的是台灣的地位和與台海對岸共產黨鄰居如何打交道的問題。

無論誰當台灣總統，島內的緊張局勢和台海兩岸的民族主義傾向也許都將增長。陳水扁的目標是2006年修憲，然後宣佈獨立，這樣,中國領導人中保守派和軍人的力量將得到加強，並刺激他們進行軍事冒險。所以這次選舉的真正輸家並非這個或那個候選人，而是地區的安定。」

日報的一篇文章標題是：「小小的勝利，大大的疑問」。文章對陳水扁為首的綠營以微弱多數領先提出了質疑。文章寫道：

「疑慮來自星期五對陳水扁和副總統呂秀蓮的所謂『行刺』，陳呂二人受了輕傷。槍擊事件之前，所有的民調都表明，連戰將贏得大選。也許槍擊事件起到了使人同情傷者的作用，大選轉為對陳水扁有利。另外，據國民黨說，20萬軍警因此事件奉命處於戒備狀態，不能參加投票，他們中有很多人一向投國民黨的票，僅他們的票，就足以改變選舉結果。

警方試圖用狂熱分子行為的說法來解釋這起槍擊事件。紐約時報記者從案發地報導說，對案件的調查『馬馬虎虎』，作案地點很快就向公眾開放了，作案的彈殼是星期六一家商店的老闆後來在一輛汽車下發現的。」

法蘭克福新報認為，這場選舉把台灣推進了一場政治危機。在談到選舉對台海兩岸關係的影響時，該報說，台灣公投沒有獲得通過，對北京只是一服安慰劑，但北京領導人不願看到陳水扁當選的事情還是發生了：

「這次選舉，中國政府首次沒有以武力相威脅。由於這樣做並沒有能阻止陳水扁再次當選，北京就要檢驗這種新策略了。現在，主張採用溫和做法的中國黨和國家新領導人胡錦濤必須向軍隊和黨內的鷹派做出解釋。但畢竟胡錦濤成功地促成美國、法國、甚至德國批評台灣的公投，所以台灣公投失敗是胡錦濤的一項成就。」