「吳釗燮警告人們注意中國快速增長的國防預算。他說，中國的 784 枚短程導彈在威脅台灣。如果台灣不加強自己的防禦能力，國家安全將受到『嚴重威脅』。然而反對黨設置障礙，利用在立法院佔多數的地位削減國防部預算。同樣，反對黨也阻攔從美國購買帶有反導彈體系的驅逐艦和潛艇。美國總統布希早在2001年就已答應出售這批武器。

吳釗燮管轄的部門也受到了攻擊。反對黨批評政府對北京贈送台灣一對大熊貓一事持保留態度：『你連兩只大熊貓都不讓入台，要你何用？』吳釗燮說，『我們想按瀕危動物國際公約讓大熊貓入台，但中國要以國內轉讓的形式進行。』他指責北京把大熊貓作為政治工具。

雙方總是因象徵問題爭執不休：國家身份的象徵，例如大熊貓問題，以及政治上承認台灣的問題。對北京來說，台灣哪怕爭取獲得世界衞生組織觀察員資格也具有象徵意義。台北指出，台灣有成為世界地圖上一塊白點的危險。吳釗燮說，禽流感正在我們的鄰國蔓延，台灣願意為地區的安全承擔責任。但迄今為止，北京有效地阻撓了這一切。」

全球化不是中國化

法蘭克福匯報也報導了吳釗燮的德國之行。該報注意到台灣政府正在努力在台灣人民中發展「台灣意識」：

「由於去年在區縣選舉中失利，台灣總統陳水扁陷入守勢，現在他試圖按照自己的意願重新啟動這個島國的政治。他發表新年致詞時說，台灣缺少『國家認同感』，應樹立『台灣
意識』。在大陸上一些戰略家敏感的耳朵聽來，這樣的聲調已接近按『反分裂國家法』進行懲治的程度。北京以極其想當然的態度認為，它有權對台灣是否在走向形式獨立的問題自行做出判斷。

在經濟領域，台灣政府試圖做一些也許可以稱為緩慢撤離大陸的工作。陳總統認為，這個民主島國現已過分依賴大陸。按照官方的說法，畢竟50%的台灣直接投資流向中華人民共和國，實際上可能高達60%。陳水扁在新年致詞時說，全球化並不是『中國化』。所以現在政府要求台灣企業家，向越南、墨西哥或東歐各國投資。」