投票錯誤可謂五花八門，有的是在選票上將圈錯劃了位置，有的沒有看見候選人名單，有的將填寫好的選票裝錯了口袋。儘管如此，執政黨仍然堅持沒有發現系統性有意違章行為的說法，認為大多數錯誤可以歸結為馬馬虎虎、缺乏認真態度所致。

台灣媒體報導，消息人士透露，重驗開始前夕，陳水扁擔心重新計票的結果對自己不利，恐怕導致翻船。為討教，陳水扁暗訪了前任總統李登輝。據說，李登輝對陳水扁說，5月20日就職之事已是既成事實，它不取決於驗票的結果。李還暗示陳水扁先卡住總統大位，「屆時即便驗票結果不利於扁呂，但執政權畢竟是在泛綠陣營手中，連宋想要翻盤，殊非易事。」台灣的媒體報導繼續寫道，李登輝還提醒陳水扁，即便驗票翻盤，泛綠仍有600多萬選票實力，這是支持扁呂的後盾，陳水扁應好好運用。

藍營國親派是本次重新驗票的發起者。他們已向台灣高法呈交了訴狀，要求宣佈該次選舉無效並重新舉行大選。驗票是為了找出證據，證明今年3月20日的總統大選機票過程中有嚴重失誤，以便為重新選舉提供依據。

然而，離3月的選舉畢竟過去了一些時日，台灣市民已從大選後的激動狀態中逐漸恢復，開始關注其它問題。台灣有線電視台周一追蹤報導首日驗票的情況，很顯然，人們對此的關心有了很大程度的降溫。目前，台灣人普遍承認，此次大選在計票問題上犯有許多錯誤，整個選戰尤其是接近尾聲時發生一連串尚待查明事件，弄得台灣選民對選舉結果和選舉本身產生懷疑。此外，為什麼要把公投同總統選舉兩項內容上毫不相干的事情硬牽扯在一處，也讓人們質疑。

不過，大多台灣公民還是希望在澄清公道公道之後，不必再舉行一次總統選舉。一名56歲的退休教師對記者說，對今後的選舉來說，重新計票是一次教訓，因此是必要的，但選舉結果沒有必要被全盤推翻。「重新計票說明，台灣的民主思想和民主機制還有待成熟。」

台灣最高法院法官以及負責本次驗票的官員拒絕每日公佈一次驗票結果。目前，大約找到兩萬張疑問選票，台灣高法將對每張選票單獨做出裁決，決定它們是否被重新計入。