台灣立法院於11月27日通過的公投法主要以國民黨和親民黨組成的所謂泛藍軍團提出的草案為基調，也就是說，排除了將「國旗、國歌、國號、領土」等項變更列入公投範圍的敏感性條文，即所謂的設限公投。國民黨陣營原本抵制民進黨政府推動修憲，近日態度卻發生轉變，國民黨主席連戰提出台灣修憲三部曲。輿論認為，這是國民黨鑑於2004年大選，轉變立場爭取選票的策略。

台灣朝野各黨11月27日提交立法院的待審議公投法有多個版本，包括民進黨提出的行政院版，國親聯盟的國親版，台灣團結聯盟黨版和民進黨立委蔡同榮提出的蔡版。幾個版本中最具爭議的焦點集中在公投適用事項、提案權和成立要件等。

在對提案進行的逐條表決中，由於國親黨陣營具有在立法院中席位較多的優勢，大多通過的是國親版條文，如公投的發動權只限於人民、政府機構無權提出公投，以及設立公民投票審議委員會來決定公投議題等。

但另一個關鍵性條款，即民進黨提出的防禦性公投獲得通過。根據該項條款，台灣在遭到外力威脅時，可就國家安全事項進行公投。觀察家認為，該條款使台灣在大陸武力攻台的情況下發動公投，由民眾決定是獨是統成為可能。因此，大陸官方網站新華網在文章中就指出：「公投法的某些條文為台獨分子進行分裂國家活動留下了隱患。」

至記者發稿時止，中國國務院台灣事務辦公室發言人首次就台灣公投事件表態。發言人在對媒體發表的講話中對勢態發展表示嚴重關注，並再次強調中國主權和領土的完整。發言人說：「任何人試圖把台灣從中國分割出去，是我們絕對不能容忍的。」

尚在周三，國台辦發言人張銘清在記者會上還警告說，如果台灣通過不設限公投法，大陸將做出強烈反應，至於是什麼樣的強烈反應，過幾天就會很清楚。輿論認為，從大陸此次的激烈措辭以及東南沿海的軍隊調動來看，這意味著武力攻台在所難免。設限公投法的通過看來暫時避免了雙方的一場正面交火，但民進黨是否會提出復議案，台灣政局將如何繼續發展，仍有待觀察。