國際特赦組織對美國中情局提出了嚴厲的指責。該人權組織解釋說，他們有線索表明，美國曾展開大規模的秘密行動，劫持並在秘密地點關押恐怖嫌犯。根據有關消息，美國中情局通過屬於私人公司的飛機運送這些俘虜。而實際上這些公司只是一種偽裝。國際特赦組織的德爾金表示：「我們的報告顯示，美國中情局利用私人飛機以躲避國際空中運輸條例。私人飛機可以在商用機場降落而不受檢查。」

國際特赦組織表示，在2001年至2005年之間總共有大約1000架飛機與美國的情報部門有直接聯繫。而其中的大約600次運送行動曾經過美國中情局插手：「賴斯說，這些飛行對於打擊恐怖主義來說是必不可少的。它們可以挽救人的生命。這種說法是完全錯誤的。那些飛行的目的是將被劫持者從羅馬等城市運往設在例如摩洛哥、約旦或者敘利亞等國的秘密監獄。囚犯被關在那裡，沒有律師，與外界失去聯繫，有時還會遭到刑訊。」

國際特赦組織的最新報告中將三名葉門人作為例證列了出來。這三個人因被懷疑是恐怖分子在2003年遭到逮捕，他們被關押在東歐或者中亞超過一年。這些人的證詞描述了他們如何被帶上飛機，又幾經輾轉被送到一個時區、氣候完全不同的陌生地點。那些中轉站裡也包括他們自己的家鄉。國際特赦組織的德爾金說：「這些人講述了美國看守怎樣費力地保守監獄所在地的秘密。他們連食品上的標籤都撕得乾乾淨淨，生怕人們通過產地推測出監獄設在哪裡。」

三名葉門人的一些說法與德籍黎巴嫩人艾爾-馬斯裡的描述非常一致。根據艾爾-馬斯裡的證詞，他2003年在馬其頓被捕，之後被送往阿富汗關押了5個月。國際特赦組織的報告還指出，很多美國中情局的飛機有可能曾途徑歐洲的領空，並且有可能將德國和英國作為中轉站。「美國中情局一支飛行艦隊中的4架飛機曾在過去5年中經常使用英國機場。次數超過180次。由美國中情局操縱的私人飛機經常在格拉斯哥、盧頓、斯坦斯特德或者貝爾法斯特等機場起飛降落。」

根據國際特赦組織的消息，恐怖嫌疑人不僅被送往阿富汗，還被送往伊拉克或者位於古巴的關塔納摩。除此以外，人們還懷疑土耳其、羅馬尼亞以及阿爾巴尼亞也設有或者曾經設有美國的秘密監獄。

國際特赦組織呼籲美國立即停止劫持行動。為此，今後情報部門使用的飛機都應該標誌為「官方使用」而不是「民用」。國際特赦組織稱，這樣一來，美國中情局就不可能再逃脫地方當局的檢查。

美國中情局的一位發言人說，對於國際特赦組織的此份報告，他不作評論。