中國駐日大使王毅稱，小泉首相參拜靖國神社之舉是對中國人民的嚴重挑釁，小泉必須承擔破壞中日關係的歷史責任。

與往年參拜略有不同的是，小泉首相沒有如一般慣例身穿和服，而是身著深色西裝；也沒有記名和交付獻花錢，更沒有進入靖國神社正殿，只是下車走到一般參拜處匆匆參拜後即離去。觀察家分析說，這或許是受此前日本的高等法院首次判小泉參拜違憲的影響，而要強調所謂「私人」色彩。

根據新華社報導，王毅大使表示，中國政府堅決反對小泉首相在任何時間、以任何形式再次參拜供奉著甲級戰犯的靖國神社。此間日本駐華使館提醒在華日本人應該遠離有可能再次發生反日遊行的場所和地點。

投資家擔心小泉首相的參拜行為會對中日兩國之間經濟關係產生負面影響。日本對華出口量佔其總出口量的13%，兩國之間年貿易總額達到2120億美元。今年4月中國各地舉行大規模反日遊行的時候，日經股票指數（Nikkei Index）明顯下挫。

另據韓國聯合通訊社報導，韓國總統府對日本首相小泉純一郎參拜靖國神社表示強烈不滿，並準備取消韓國總統盧武鉉年底的訪日計劃和APEC峰會期間的韓日峰會。韓國外交部長潘基文今日在漢城召見日本駐韓大使大島正太郎時說，韓國政府多次要求日本首相不要參拜供奉戰犯的靖國神社，但小泉仍然強行參拜。韓國對此感到十分遺憾和失望。

日本各地法院至今就小泉首相參拜靖國神社是否違憲一案判決結果各異，日媒體對首相參拜之事的反應也各不相同。

背景：小泉就任首相後五次參拜靖國神社

2001年8月13日：小泉第一次參拜靖國神社。

2002年4月21日：小泉第二次參拜靖國神社。

2003年1月14日：小泉第三次參拜靖國神社。

2004年1月1日：小泉第四次參拜靖國神社。

2005年10月17日：小泉第五次參拜靖國神社。