外界長期以來就對巴基斯坦是否捲入向其它國家提供核技術存在質疑。去年11月，國際原子能機構根據伊朗提交的該國核計劃資料，認為巴基斯坦官員涉嫌出售核情報。巴基斯坦政府迫於國際壓力，正式就此開展調查，主要對像是卡迪爾汗及其曾領導的核實驗室的科學家。巴政府官員稱，卡迪爾汗承認在80年代後期至90年代中期向伊朗、利比亞和北韓出售了過期的技術圖紙和設備，但是在軍方的間接授意和參與之下。巴軍方立即予以否認，稱軍隊從未捲入這一秘密交易。並強調，穆沙拉夫總統執政以來，沒有再發生過此類交易。

分析家普遍認為，由於軍隊在巴基斯坦的特殊地位，不可能與此無涉。柏林科學與政治基金會的南亞問題專家華格納博士認為：「鑑於核計劃對巴基斯坦至關重要，而軍隊又是國家的主導力量，所以軍方不可能對此一無所知。軍隊在巴基斯坦有神聖不可侵犯的地位，可以想像，卡迪爾汗和其它科學家是這一事件的犧牲者，讓他們承擔罪名，以保住軍隊不可動搖的地位。」

卡迪爾汗是巴基斯坦第一個核實驗室的創建人，在他的領導下，巴基斯坦躋身世界上少數掌握核技術的國家。卡迪爾汗因而被視為民族英雄。

在巴基斯坦國內，反對派和伊斯蘭民族主義力量強烈指責了政府這一舉動，批評穆沙拉夫對美國俯首聽命，不惜斷送本國的核計劃前途。巴基斯坦議會中的主要伊斯蘭黨派聯盟已號召國民舉行總罷工，抗議政府給卡迪爾汗定罪。華格納博士認為：「穆沙拉夫面臨巨大的國內政治壓力。巴基斯坦最大的伊斯蘭黨派極力支持卡迪爾汗，媒體也指出核技術交易不僅是出於經濟目的，而且有政治背景，至少當時的軍方高層人士對同伊朗等國家進行核技術方面的合作頗感興趣。」

德國之聲南亞部編輯侯塞因沙認為，包括軍方在內很多人都不希望卡迪爾汗被送上法庭。周三，巴政府官員向媒體透露，穆沙拉夫總統當天已同卡迪爾汗會面，但沒有透露會談的具體內容。據稱，卡迪爾汗就出售核技術情報一事向穆沙拉夫正式道歉。侯塞因沙認為，這或許是政府方面向卡迪爾汗提供的機會，一個溫和體面的台階，由此低調處理這一事件，避免不必要的風波。