歐盟和非洲聯盟在最近的一次高級會晤時就一些重要議題上仍然存有重大分歧。周二晚，歐盟與非洲聯盟公佈了一份閉幕文件。此前，非洲方面批評歐方計劃的對非洲高級人才簡化入境手續事宜。他們認為，這樣做，會導致專業人才從非洲流失，而恰恰是非洲特別急需專業人才。不過，歐盟方面做出承諾，他們將制定有關的政策法律，讓以上提高的風險不致出現。此外，歐非雙方還在國際法解釋上意見不同。非洲聯盟擔心，國際法庭因戰爭罪以及反人性罪法律追究，會對一個國家的主權產生質疑。他們提出避免濫用該法的警告。但歐洲方面則一再強調，所犯罪行不能不受懲罰。

另外，歐盟同非洲聯盟計劃最遲2009年簽署經濟夥伴協定。雙方就此議題進行了長時間談判。法國發展部國務秘書承認，歐盟方面如果想讓談判進展順利，就必須在對非洲的發展政策領域做出更大的改善。許多非洲國家激烈批評這一經濟夥伴協定，因為擔心一旦對歐洲的產品和服務開放市場，不能從中得到任何經濟實惠。