中國與羅馬教廷建立正常關係有兩大障礙：首先，梵蒂岡與台灣保持外交關係。依照「一個中國，台灣是中國不可分割的一部分」的原則，梵蒂岡必須與台灣斷交後才能與中國建立外交關係。梵蒂岡可以接受中國的原則，因為世界上絕大多數國家都認同北京的原則，採取靈活的做法，與台灣保持非正式、但具有實質性的關係。多年來，流傳的中梵談判建交的消息一再引起台灣的驚慌：梵蒂岡是台灣在歐洲的唯一有正式外交關係的國家，一旦失守，台灣也就失去了在歐洲雖然是最小一塊、但也畢竟是正式的一塊外交陣地。

中梵多年來外交關係沒有突破，關鍵在於第二個障礙：羅馬教廷要求恢復對中國天主教主教任命的權力，從而可以從組織結構上對中國教會施加影響。在這個問題上，中梵雙方互不讓步，梵蒂岡堅持其任命主教的權力，而中國的共產黨領導擔心「外國反動勢力披著宗教的外衣對中國實行滲透」。中國外交部發言人劉建超就教皇保羅二世逝世發表談話時重申了中國的兩項原則：梵蒂岡應結束與台灣的外交關係，承諾不干預中國內政，包括中國的宗教事務。

中國官方的「愛國天主教會」不承認羅馬教皇的權威，只把他看作是宗教首領。星期天，保羅二世去世的消息傳出後，中國的教徒為他的靈魂祈禱。從北京天主教堂傳出的圖象表明，中國的教徒對教皇逝去流露出真心的悲痛。中國官方也表示了哀悼。

與「愛國天主教會」的五百萬教徒相比，只承認教皇權威的中國地下教會人數眾多，參加地下教會活動的信徒估計最多可達1200萬人。北京要求所有的天主教教徒都到「愛國天主教會」登記，在國家「管理」下舉行宗教活動。對地下教會的宗教活動，中國的國家機器從不手軟。前不久，傳出了溫州86歲的主教林希力被捕的消息。上星期，宣化教區的神甫趙振東被警方帶走。他們二人都是地下教會的神職人員，效忠於羅馬教皇。

中國國家對教皇保羅二世去世的消息採取了嚴格控制報導的做法，觀察家們認為，共產黨領導顯然想避免中國社會出現一場對這位最高宗教領袖一生的討論。出身波蘭的保羅二世生前推動了波蘭共產黨政權的倒台，從而開啟了整個東歐共產陣營的覆滅，評論教皇，不可能不談及這一歷史事實。對中國政府來說，當然是不談為妙。還有一件北京密切關注的是，台灣的陳水扁是否會像其它國家元首一樣，前往梵蒂岡參加保羅二世的葬禮。

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