台灣反對黨民進黨主席蔡英文表示，馬英九總統所提出的與大陸簽署和平協議的考量將有損於台灣的主權。蔡英文周三在一份回應馬英九有關講話的聲明中，再次指責馬英九此刻拋出兩岸和平協議，將使台灣人民面臨四個危險，包括犧牲台灣主權、改變台海現狀、危及民主價值以及破壞戰略縱深。 周一，馬英九表示，在國家需要、民意支持和國會監督的前提下，未來10年內不排除與中國大陸簽訂兩岸和平協議。反對黨陣營連日來對此展開強烈批評，民進黨認為「兩岸和平協議」就是「統一時間表」。