當薩達姆-侯賽因周三被移交給伊拉克政府時，他態度友好地說了一句：「早上好！」一名法官將對薩達姆的書面起訴交給他。伊拉克特別法庭負責人薩利姆-沙拉比對記者描述說：薩達姆的狀態良好，他的頭髮和胡須梳理整齊，不是像去年12月被逮捕時那樣雜亂。薩達姆想問幾個問題，但法官說他必須等待24小時。

沙拉比說：「薩達姆是被逮捕的前伊拉克政府高級官員中第一個亮相的，他有些消瘦，不像我們以前在電視中熟悉的那樣魁梧。他顯得有些緊張，因為他不知道將受到怎樣的處置。」

周四，薩達姆出現在法庭，沒有戴鐐銬。他和11名昔日的親信聆聽了對他們的起訴。之後，法官宣佈對他們下達逮捕令。被告有機會對各起訴點口頭表態。

據美國有線新聞電視網CNN報導，薩達姆對法官說：「這一切都是在演戲，真正的罪犯是布希。」法院宣讀對他的7項起訴之後，薩達姆不願在起訴書上簽字。薩達姆還對91年入侵科威特進行辯護。

據CNN報導，當法官請薩達姆自我介紹時，他說了兩次：「我是薩達姆-侯賽因，伊拉克總統。」

被告還有前伊拉克政府的11名高級官員，包括前副總理阿齊茲和以「化學阿裡」著稱的薩達姆的堂兄。

訴訟程序還有幾點有待澄清。比如：特別法庭進行審理的法律基礎沒有公開。出於安全考慮，法官和律師的名字也將保密。

另外薩達姆的辯護人是誰還不清楚。依照伊拉克法律，薩達姆的辯護律師應當是伊拉克人。法國和約旦已有律師表示願意為薩達姆辯護，據說他們得到了薩達姆家族的請求。一再對薩達姆案件的進展發出公開抱怨的約旦律師拉什丹說：「對伊拉克發動的戰爭已屬非法，現在設立的特別法庭是非法的，法官是非法的，一切都是非法的。」

一名法國律師批評說，伊拉克的法律極為落後。審訊的唯一目的是盡快將薩達姆判處死刑。