台灣政府從一開始就對連戰的此次大陸之行提出強烈批評，但台，灣總統陳水扁目前的口氣已經有所緩和。他說，他將連戰的此次訪問視為中國大陸是否有意與台灣改善關係的一次測驗。

黨主席連戰前往中國大陸進行歷史性訪問前夕，國民黨總部喜氣洋洋。連戰將此次大陸之行稱作和平之旅，一次能夠緩和兩岸緊張氣氛的訪問。在記者招待會上，連戰就是否將和中國國家主席胡錦濤談及「反分裂法」的問題時回答道：

「我想，我們交流的話題沒有任何限制。當然我將利用這次機會談及我們的人民最為關心的問題，其中當然不排除您提到的反分裂國家法。「

在台灣，人們對連戰的大陸之行反應不一。主張獨立的台聯黨精神領袖，前台灣總統李登輝抨擊國民黨出賣台灣，葬送台灣的民主。台聯黨在連戰一行離開台灣時在中正機場舉行了示威遊行，並引發了藍綠陣營間的一場輕暴力衝突。

台聯黨立法委員黃主文指責國民黨受到北京的利用：「中國應該和台灣政府直接對話，而不是和反對黨對話。我想中國真正的目的並不是談判，而是操縱台灣的政治。台灣面臨著一個關鍵的時刻。國民黨和中國在互相利用，中國利用國民黨使台灣的政策取向更有利於中國，國民黨則利用中國為下屆總統競選服務，但是，他們這樣做是在犧牲台灣的利益。「

一開始對連戰訪問大陸提出批評的台灣政府，目前口氣上有所緩和。台灣總統陳水扁說，如果反對黨按照法律辦事，不與北京簽訂未經台灣當局批准的條約，那麼他會支持這次訪問。台灣政治大學國際關係研究中心的中國問題專家蔡瑋表示，他相信此次訪問能夠對緩解兩岸緊張關係帶來積極的影響。蔡瑋說：

「這次訪問的象徵性意義非常重要。中國當然會展示一些良好的願望，來贏得台灣人民的好感。它將是一個突破。我認為連戰能夠帶回一些實質性的東西。如果中國同意減少面向台灣海峽的導彈數量，或者同意考慮與台灣簽訂臨時協議的可能性，那麼這將是連戰的一個重大的成就，最終對台灣也是一件非常好的事。「

作為即將卸任的反對黨領導人，連戰希望奠定自己的歷史地位，此次訪問也許能夠給他提供這樣的機會，也能給台灣和中國大陸消除政治分歧，開始對話，為促進該地區穩定帶來一次多年不遇的良機。

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