今年三月台灣在野黨國民黨主席馬英九風光訪問美國，獲得美方高規格接待，讓執政的民進黨備感壓力。民進黨政府本想藉著陳水扁總統此次出訪中南美洲友邦時過境美國的機會，和馬英九別苗頭，不料行程規劃，一波三折。基於外交處境的考慮，台灣駐美代表處是在中國國家主席胡錦濤結束訪美行程後，才向美方提出申請，希望能讓陳水扁在紐約或舊金山過境，美方卻遲遲沒有答應，而且還另外建議安克拉志為過境地點。

由於過境地點始終無法敲定，出訪行程因而延後一天，雖然5月3日台灣外交部長黃志芳表示，台灣能體諒美方的考量，陳水扁總統往返都將過境安克拉志。但最後陳水扁還是不滿過境美國的安排，決定不照原計畫過境，他在出發前批評這都是中共打壓台灣的結果。

對於陳水扁總統出訪前，質疑這次過境美國不順的原因，是中國和國民黨作梗，馬英九意在言外的說，全國人民都應該知道是什麼原因，不要把責任都推到外交系統。

台灣元首出訪，行程卻成謎，曾經擔任過外交部長的國民黨立委蔣孝嚴說，這是陳水扁操作終統議題的結果，卻讓全體台灣人民蒙羞。

面對泛藍方面的批評，泛綠方面自然是全力護航，民進黨立委陳景峻說，外界不該再對此事冷嘲熱諷。他說，大家好像在以幸災樂禍的心情看待國家元首的出訪。

陳水扁臨時決定不過境美國，美方只表示這是台灣的決定，這樣的反應似乎也透漏幾許無奈，而陳水扁反將美國一軍的做法，是否會影響美台關係，外交部長黃志芳說，應該不會。他說，台美關係的基本點仍然非常好，雙方有非常堅實共同的利益。這次的確是特定時空之下所做的特定安排。

已退休的台灣資深外交官陸以正表示，民進黨該覺醒，不要再用過境美國的手法拉抬自己的聲勢。他說，所謂過境外交，就是公關小組的人到旅館裡去看看他，這樣就很得意，回來說在外頭拼了外交了。美國看透了這一套。這次終統完全不聽美國的，所以美國也讓你看一看，如果美國不睬你，你會有多慘。

陳水扁預計在結束哥斯大黎加的訪問之後，將在9日啟程返國，回程會在哪哩過境，目前還是個謎。