馬英九和王金平是勢均力敵的國民黨重量級人物。英俊瀟灑，魅力十足的馬英九在民調中佔了上風，而64歲的王金平則被視為深受黨內基層的擁護。

台灣東海大學政治學教授王冶力（音）評價說，兩位候選人都具有獨特的但完全不同的領導才能，兩人都是溫和的實用主義者，沒有採用極端的手段去拉選票。

馬英九和王金平都將反腐敗，推動民主改革，促進黨內派系的團結作為自己的競選綱領，都強調要維護台灣的主權，但反對民進黨的台獨主張。台灣國立政治大學的張林生（音）認為，選民的判斷標準是誰更有能力恢復國民黨的形象，為國民黨2000年的大選失敗雪恥，並重新贏得國民黨支持者的信任。

東海大學的王冶力教授分析說，王金平是一位老練的政治家，一位經驗豐富的談判家，利用過去積累的經驗，他無疑能夠更好地協調國民黨的基層派系。此外，他在反對黨佔多數的立法院中擁有的權力也是他的一項資本。從1976年以來，王金平長期擔任立法委員，擅長與強大的利益集團，院外活動團體和基層派系打交道。

55歲的馬英九則非常注意和商業團體保持距離，避免任何政治交易。1996年，因施行有力的反腐措施，擁有哈佛大學法學博士頭銜的馬英九丟掉了司法部長的職位，但卻在選民中樹立了良好的形象，尤其得到了年輕人的敬愛。有人分析說，馬英九代表的是誠實正直的新形象，在當今的政治家中非常罕見。但是，這樣的品質雖然受到許多人的敬重，另一些人則認為這是政治上軟弱的表現，不適合擔任黨魁。

儘管馬英九和王金平的競選陣營都表示進行一場乾淨的競選，但是，雙方都互相指責對方有「違規「行為。馬英九的陣營譴責對手大擺宴席拉選票，為支持者提供免費旅行的機會，以不符合規則的程序吸收了約5000名新黨員。王金平的陣營則指責一些馬英九的支持者在競選集會中分發禮品。

國民黨現任主席連戰已明確表示他將於8月退出台灣政治，並致力於改善海峽兩岸關係。

觀察家認為，不管馬氏還是王氏擔任國民黨新主席，他就任後面臨的第一個挑戰就是協調與親民黨和新黨的關係，迎接12月的地方選舉。一個分裂的國民黨將帶來很多內耗。由國民黨，親民黨和新黨組成的泛藍陣營十分清楚，他們必須聯合起來才能贏得未來的選舉。儘管泛藍陣營在立法院中略佔多數，但民進黨籍總統陳水扁卻掌管政府，自然擁有更大的權力。

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