穆佐迪被指控對911事件中罹難的3000多人犯有謀殺同謀罪及加入恐怖組織罪。根據美國情報機構提供的消息，穆佐迪在德國漢堡與另外兩個涉嫌駕駛飛機飛進世貿大廈的阿塔和舍希共同居住在一個公寓內。

控方：「穆佐迪是同謀。」

檢察署指控穆佐迪在漢堡科技大學學習時，作為穆罕默德.阿塔的同學，曾經在阿塔的遺書上簽名。此外，他還和其他的恐怖組織成員一起去基地組織訓練營接受過培訓。他在基地組織受訓的時候，就參與了911事件的計劃和籌備。檢察署認為，穆佐迪一直到最後一刻，都是漢堡恐怖組織的成員。

今年二月，全世界範圍內的首起因911事件在漢堡高級州法院接受庭審的摩洛哥人默塔薩德克被判罪名成立，監禁15年。當時檢察署指控的和現在指控穆佐迪的是同一罪名。默塔薩德克在他的證詞中承認曾經在基地組織的訓練營中看到穆佐迪。

辯方:「特殊的文化背景」

辯方試圖說服法庭，穆佐迪僅僅是基地組織的一個小人物。他絕不是本拉登的恐怖組織的核心人物。根據穆佐迪律師的說法，他的行為有其獨特的文化背景。作為一個穆斯林信徒，當別人求上門來的時候，穆佐迪只是想對教友提供經濟上的援助。他本人並不知道這筆錢將用在何處。在阿拉伯地區，這種無私的不問究竟的經濟援助是理所應當的事情。這種類似的情況是西方社會無法理解的。指控穆佐迪對恐怖活動提供經濟支持是錯誤的。

穆佐迪於2002年10月被捕，此後一直被關押。在這一庭審過程中，他對檢察署的指控將保持沉默。一共將有124人出庭作證。觀察家估計，整個庭審將持續到2004年。