鑑於高額進口稅，拉美主要的香蕉產地巴西、哥倫比亞、哥斯達黎加、厄瓜多爾、瓜地馬拉、宏都拉斯、尼加拉瓜、巴拿馬、委內瑞拉都向位於日內瓦的世界貿易組織提出了申訴。歐盟農業委員會專員馬麗安‧菲舍爾‧伯爾（Mariann Fischer-Boel）在布魯塞爾提交的一份書面報告中稱，因為預計與這些申訴國家間就香蕉進口關稅高低的談判很可能未果，另外考慮到該項新稅額生效日期的臨近（2006年1月1日），所以歐盟極有必要再次向世貿組織提出仲裁申請。

歐盟每年給予非洲、加勒比海及太平洋地區的歐洲前殖民地國家77.5萬噸免稅香蕉進口配額，以保證來自這些國家的水果在歐洲市場上的份額。儘管如此，這些國家仍然抱怨該配額量過小。同時，來自拉美的香蕉生產大國則認為歐盟給予了非加太國家特惠待遇，通過稅收人為地抬高了香蕉在歐洲的價格，從而傷害了拉美的利益。在前幾輪的「香蕉戰」中，世貿組織已經在原則上認可了歐盟給予這些貧窮國家的優惠待遇，而這次的「香蕉戰」只涉及進口稅額的高低。

這些所謂的「香蕉專政」取代了以往複雜的市場配額和稅收等規定。歐盟之前對拉美國家的香蕉進口規定是，拉美國家在每年220萬噸的進口配額下，每噸香蕉應繳納75歐的進口關稅，超過部分的稅率則為每噸680歐。由於許多經銷香蕉的拉美公司都是由美國大公司控股，所以當時拉美香蕉生產國在美國的支持下就歐盟對香蕉的市場規定向世貿組織提出申訴。世貿組織早在2000年就已經否決了歐盟的香蕉進口制度並要求歐盟出台新的規定。

拉美和歐盟的「香蕉戰」可以追溯到九十年代。現任歐盟貿易委員會專員彼特‧曼德森（Peter Mandelson）認為，「香蕉戰」對許多生產香蕉的發展中國家之間的關係產生了消極影響，希望盡快結束持久的香蕉貿易爭端。歐盟將會遵守2001年世貿組織多哈會議上就香蕉達成的協議。

世貿組織將在30日內就歐盟提出的申請作出裁決。

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