冠軍聯賽抽簽依據以下4點規則：

1. 來自同一足協的球隊不得交手；
2. 小組賽階段曾經遭遇過的兩支球隊不再交手；
3. 小組第一之間不得交手，第二亦然；
4. 所有的小組第二先打主場。

抽簽儀式在德國時間中午12點進行，八個小組第二巴塞羅納、埃因霍溫、羅馬、皇家馬德里、凱爾特人、波爾圖和裡爾和國際米蘭將先打主場，八個小組的頭名拜仁慕尼黑、切爾西、曼聯、阿森納、利物浦、裡昂、米蘭和瓦倫西亞作為小組第一將擁有後打主場的優勢。

最終拜仁與老冤家皇家馬德里狹路相逢，兩隊歷史上在冠軍聯賽中共交手16次，拜仁9勝2平5負佔據上風，主場7勝1平不敗的戰績堪稱輝煌。在現場觀看不來梅的體育主管阿洛夫斯在現場接受歐洲體育台的採訪時表示：「我認為，在對皇馬的比賽中，拜仁很有希望繼續前進。」而皇馬出席會議的代表洛佩斯則認為，對我們而言這是非常艱苦的比賽，兩支強隊在八分之一決賽就遭遇，真的是非常非常苦澀。」

拜仁主帥馬加特在知道抽簽結果之後表示：「這是重量級的較量，抽簽之前我就說過，我們會遭遇皇馬。也許皇馬在小組賽中表現的一般，但是我相信，到明年3月份，皇馬會變得更強大。」兩隊最後一次交手是在03－04賽季的冠軍聯賽八分之一決賽，卡恩的失誤使得拜仁主場1比1戰平對手，次回合拜仁0比1失利被淘汰出局。

冠軍聯賽淘汰賽首回合比賽將在2月20和21日進行，次回合比賽將在3月6日和7日進行。

13點進行了聯盟杯的抽簽儀式舉行，根據的是以下4點規則：

1. 來自同一足協的球隊不得交手；
2. 小組頭名將遭遇小組第三；
3. 小組第二名將遭遇冠軍聯賽的小組第三；
4. 小組頭名和小組第二將後打主場。

聯盟杯中德國尚有兩支球隊，一支是失意冠軍聯賽、僅僅獲得小組第三的不來梅，一支是在最後一輪才晉級的勒沃庫森。結果勒沃庫森遭遇了英超強隊布萊克本，不來梅則和阿賈克斯狹路相逢，聯盟杯淘汰賽首回合於2月14和15日進行，次回合比賽於2月22日進行。

冠軍聯賽抽簽結果：

拜仁慕尼黑－皇家馬德里

切爾西－波爾圖

曼聯－裡爾

阿森納－埃因霍溫

利物浦－巴塞羅納

裡昂－羅馬

米蘭－凱爾特人

瓦倫西亞－國際米蘭