寒假過後，台灣即將引入大改版的新編中學歷史教科書。有關中國歷史的部分被大大縮減，並將大陸，我國通通改稱為中國，也不再提光復大陸或者台灣是中國民主的榜樣。台灣反對黨國親陣營指責說，新編歷史教科書是政府企圖割斷台灣與大陸歷史聯繫的又一次嘗試。而在台灣政治大學國際關係研究所副研究員湯紹成看來，此舉是現政府文化台獨的重要步驟：

「因為我們始終認為兩岸最起碼是在文化歷史上還是一體的，但是他們現在的做法把兩者完全分開了。比如清朝人移民到台灣來是我們通用也是可以接受的說法，他們改為殖民，就像以前西班牙在台灣的情況一樣。這裡面可以看到非常明顯的文化台獨的企圖。」

國民黨，親民黨諸多立法委員都對新編歷史教科書抹煞台灣與中國的歷史淵源予以譴責。親民黨立法委員馮定國諷刺說，如果教育部長杜正勝不承認孫中山為國父，那他應當馬上宣佈前總統李登輝或者現任總統陳水扁是台灣的創建人。然而， 儘管有諸多不滿之聲，但由於台灣立法院目前正值冬季休會期，分析家因此認為，新編教科書也就成為了既成事實。即便立法院今後再作討論，其效果也會大打折扣。而相對於法理台獨，文化台獨受到的外界阻力也很小。

對於美化日本對台灣的佔領，將日佔改為日治，湯紹成認為，這是台灣政府企圖討好日本，為台獨爭取支持的又一證明：「能給走向台獨的方向給與支持的，我想日本其實也是一個非常重要的國家，因為它不願見到中國日益強大，希望兩岸能夠起到牽制的作用，甚至導致戰爭，甚至讓美國也牽涉進來，這樣日本就可以坐收漁利，這正好和主張台獨的人士一拍即合。所以對於日本在台灣的這一部分歷史他們盡量給與美化，這當然有政治的意圖。」

由於新編歷史教科書對下一代不容低估的影響，台灣民眾中許多人對現政府醞釀的文化台獨表示不滿。湯紹成說：「現在所謂的文化台獨的部分我覺得已經讓很多人感到無法忍受了。我想反彈的力度可能還是會很強。在野黨除了在立法院當中的前之外，可能還會用其它方法來做補救，比如說要提出其它的說法，或者保持原來的講法。」