由陳水扁所在的民進黨在立法院的選舉當中勝出。而國民黨失去了對立法院的控制地位，遭受失敗。在台灣歷史上，國民黨第一次不再於立法院中佔有大多數席位。

由於沒有絕對勝出者，所以將在台灣組成聯合政府。

據截稿時得出的投票結果，台灣媒體報導，國民黨由原有的110個席位減少到68個，只得選票的31％。而民進黨由過去所佔的66個席位增加到87個，得票39％。直接選舉出的立法委員共有168位。其餘的41個席位將由投票結果之比例給各黨分配。剩下的16個席位是留給原著民以及僑居國外國民。

由宋楚瑜領導的親民黨得46席。李登輝支持的台聯黨得13個席位，李登輝對選舉結果表示滿意。

選舉的結果增添了中國政府的擔憂，即主張台獨的趨勢將有所加強。