1月28日，哈馬斯政治領袖哈立德‧馬沙勒在敘利亞發表聲明，稱哈馬斯準備與其它政治派別聯合起來，組建一支自己的軍隊，來保護巴勒斯坦人民，抵禦以色列入侵。馬沙勒說：「只要我們還被佔領，我們就不會停止反抗。」

此前，哈馬斯高級領導人哈尼耶赫拒絕了國際上提出的要求極端伊斯蘭組織解除軍事武裝的願望。在哈馬斯出人意料地勝出大選之後，許多國家紛紛表示，如果哈馬斯仍然不肯放下手中的武器，他們將要取消對巴勒斯坦的國際經濟援助。

代表哈馬斯參加選舉的哈尼耶赫在加薩地帶接受路透社採訪時稱：「這種經濟援助並不是懸在巴勒斯坦人民頭上的劍，也不可能成為威脅民眾的工具。我們不答應這樣的要求。」也就是說，哈馬斯將繼續武裝反抗以色列的佔領。

另外，下屬於法塔赫的軍事派別「阿克薩烈士旅」也在法塔赫競選失利後宣佈中止與以色列的停火協議。烈士旅領導人對路透社記者表示：「大選的結束也意味著停火協議的失效，」現在，「烈士旅的子彈是為以色列人以及腐敗的（法塔赫）貪官準備的。約旦河西岸的所有軍隊都已達成這一立場。」

目前還不清楚，究竟有多少烈士旅支持這個決定？駐紮在約旦河西岸城市圖勒凱爾姆（Tulkarem）的一支武裝部隊的首領稱，自己認為停火協議還是有效的。

有目擊證人舉報，他們看見法塔赫武裝分子和巴勒斯坦警察今天持槍闖入加薩議會大樓，發洩對大選結果的不滿情緒。

在約旦河西岸的另一個城市Bethlehem，今天上午有大約400名部分武裝的法塔赫追隨者佔領了黨派辦公室，要求法塔赫高級領導人辭職。一位蒙面的激進分子宣讀了一長串黑名單，其中包括法塔赫中央委員會。不過，巴勒斯坦現任總統阿巴斯並不在勒令辭職的名錄之內。抗議者還威脅法塔赫的全體政治成員，阻止他們加入哈馬斯領導下政府內閣。

以色列政府現在準備禁止加薩地帶的哈馬斯議員進入約旦河西岸地區。下達這一禁令對於以色列來說並不需要原因。以色列國防部戰略和安全規劃主任Amos Gilad還稱，一旦哈馬斯流亡領袖馬沙勒出現在由以色列人控制的區域，他將立刻遭到拘捕。據一份報紙報導，馬沙勒打算離開他所棲身的大馬士革，回到加薩。1997年9月，馬沙勒曾儌倖逃脫了以色列人的一次刺殺行動。