在台灣國民黨派團前往北京商談台商春節包機直航的同時，鮮為人知的是，由台灣政府授權的台灣民航業者正在澳門就同一議題與大陸方面的民航部門進行商談。台灣智庫國際事務部主任賴怡忠認為，國民黨這一次主動上門與大陸談包機直航是看準了爭取民心的政治機會，陳水扁政府對此報著樂觀其成的態度，但是賴怡忠說：

「國民黨並沒有得到台灣政府的授權，至於國台辦的陳雲林先生提到這是國內航線，我想關鍵的問題是這只是國民黨單方面主動去談，並不代表台灣政府。以我的瞭解，台灣方面主管兩岸直航的陸委會將首先根據兩民航業者在澳門談的結果來進行判斷。」

賴怡忠認為，陳水扁政府不會接受北京方面有關「國內航線「的提法，但台灣也不會將台商包機直航稱作「國際航線」，以免激怒北京：「台灣的看法一直是把它當作跨岸航線，所以也不是將其作為國際航線。」

從北京的角度講，在國台辦與國民黨就包機直航的問題會談後，球已經被踢到了陳水扁一方，關鍵是看陳水扁政府做出怎樣的反應。國台辦主任陳雲林表示，「如果台灣當局真正顧及廣大台灣同胞的利益，言而有信，採取靈活，務實的做法，這次台商春節包機完全可以實現。」

台灣大學政治系教授楊永明認為，在包機直航的問題上，兩岸都應該採取靈活的態度：「我認為不一定是要見諸文字或者讓對方完全接受，可以採取像以前說的各自表述的方式。不一定在事物性的問題上也要扣上政治的帽子，否則會造成實際問題沒有辦法去處理的局面。「

分析家認為，儘管時間緊迫，以雙向，雙飛，不中停的方式實現２００５年台商春季包機直航仍然非常有希望。楊永明說：

「在有實際需要，過去也做過的情況下，如果今年做不到，那其實表明今年兩岸關係走向更加對立的方向，這是北京和台灣都不希望看到的。北京現在正在制定『反分裂國家法』，如果兩岸包機直航都沒有辦法，似乎會讓整個國際社會和台灣人民感到北京採取的政策越來越對立，越來越強硬。這對北京整體或長期的對台政策是不利的。

對台北來說，陳水扁在立法院選舉中受挫，這一次國民黨站出來又讓陳水扁政府覺得被搶了光彩，但是如果不接受談判結果，造成包機直航沒有辦法實現，那更顯出陳水扁政府沒有辦法處理民間實際需要的問題，更會給人民留下他無能處理兩岸政策的觀感。所以我想陳水扁是會接受的，但可能會透過其他民間機構再去確認，或者作進一步的溝通。」