印尼軍方在那裡打擊被稱作「自由亞奇運動」的叛軍。雅加達政府最近關於亞齊省的聲明顯示，和在海嘯發生前一樣，印尼軍隊希望不受外界干擾地繼續這場戰爭。

一周前，印尼總統蘇西洛在第一次國際海嘯救援會議上表示，國際社會的幫助對印度尼西亞和其他的受災國來說具有重大的意義。隨即，蘇西洛取消了對外國人進入亞齊省的限制。

一周後，雅加達又換了一套口徑。本周三，負責亞齊事務的人民福利統籌部長阿維希哈宣佈了適用於外國記者和救援人員的新規定：誰要是離開亞齊首府班達亞齊以及西部港口城市米拉務，必須提前申請。而且，今後軍方將押運救援物資。官方表示，這樣的措施是為了保護外國人免受叛軍的襲擊。阿維希哈說：

「對印尼政府來說，目前首要的任務是在和國際社會、非政府機構以及聯合國各機構的合作下，確保人道主義救援行動成功運作。可能出現的障礙是安全問題。我們靜下心來設想，如果亞齊省的叛軍挾持了一名國際救援機構的工作人員，那麼這將帶來什麼樣的後果？！我十分肯定，這樣會嚴重影響人道主義救援。這就是我們採取措施的原因，以避免曾經發生的事情再度發生。前幾天，我們衞生部的一位工作人員被綁架。如果換成各位中的一位，您還仍然願意在這裡實施人道主義援助嗎？這就是問題所在！」

聯合國駐亞齊的救援工作協調員布特魯以50多個在亞齊救災的國際機構的名義表示，印尼軍方出自政治和安全的原因，希望能夠控制亞齊省的局勢。他還說，目前並沒有救援組織的成員覺得受到當地叛軍的威脅。

除了救援機構的成員之外，還有很多外國軍人目前逗留在亞齊省。德國聯邦國防軍在那裡建立起了一個戰地醫院，美軍的直升機頻繁地在蘇門答臘島西海岸上空飛行，澳洲、日本、馬來西亞和新加坡的軍人都在當地支持援助行動。

印尼政府要求外國軍隊救援行動最遲在三個月內結束。印尼副總統卡拉在被印尼安塔拉通訊社問到救援任務結束的期限時說：「三個月已經夠長了，越短越好！」

外界只能猜測為什麼印尼副總統會有如此言論。難道是印尼軍方不願意讓外界瞭解內戰省份亞齊更多的情報，還是他們擔心讓外國軍方幫助解決印尼國內事務丟面子，顯得自己無能呢？