貿易問題

繼2004年中美貿易美國出現1620億美元的逆差之後，本年度將持續這一發展趨勢，而且勢頭更旺。2005年的美中貿易逆差將達到2000億美元。布希總統稱這一情況令人擔憂。

美國工業界利益協會以及國會代表聲稱，導致大面積貿易逆差的原因是中國使用了不正當的競爭手段，比如人為壓低人民幣對美元的兌換率以促進出口。11月初，中美兩國就紡織品事宜達成一項為期3年的妥協協定，美國重新對中國紡織品引入配額制，就此，一場兩個大國之間政治貿易戰總算平息下來。

保護智慧財產權

布希將敦促中國政府做出更大努力，以保護專利、商標以及其他類型的智力產權並嚴厲打擊對註册產品剽竊及偽造抄襲等侵權現象。

美國電影業、軟體開發以及其他同版權有關的領域估計，去年中國侵權產品如果進入正常銷售渠道，價值約為25億美元。為安撫西方國家，中國於今年7月制定了一系列法規和措施，意在同侵權行為作堅決的鬥爭，但美國在今年10月還是動用了世貿組織雖規定、但卻極少使用的權利，要求中國拿出保護智慧財產權方面取得進步的具體事實。

貨幣問題

布希說，他將向中國方面施壓，促使人民幣更多地同市場機制掛鉤。布希讚揚了中國今年7月作出允許人民幣2.1%浮動的決定，但美國國內仍有很多人抱怨人民幣的兌換率遠遠低於市場水準，從而對美國出口產品乃至就業崗位都造成極大壓力。

到目前為止，中國一直在頂著美國要求人民幣升值的壓力，宣稱不會在近期內對人民幣進行大幅度的改革，如果操之過急，可能帶來人民幣通貨緊縮的局面。

台灣問題

美國不斷地向台灣提供武器，激起北京政府的極大不滿。美國雖然官方只承認北京政府，但卻同台北保持非官方關係並堅持對台灣的防衛負有責任。美國五角大樓公佈的白皮書稱中國的軍力不斷加強，中國軍隊的現代化建設將破壞亞太地區的平衡。今年3月中國的「反分裂法」通過後，美國更加感到不安。該法宣稱，如果台灣宣佈獨立，中國將可以使用軍事解決辦法。

人權與宗教問題

美國不斷對中國侵犯人權的現象提出嚴厲批評，指責的對象包括施刑、限制言論自由、壓制宗教信仰。但今年華盛頓放棄了在聯合國人權委員會提案抗議中國破壞人權，原因是爭取中國支持美國抗擊恐怖主義的戰爭。中國經常在重大事件發生前釋放政治犯，但這次布希到訪卻是例外。布希在京的日程中安排了前往一所教堂參加那裡禮拜的內容。