長達15頁的教皇遺囑陸續成文於教皇將近26年的任期內，內容和風格充滿了神學與宗教色彩。在1990年寫就的一章中，教皇說：「我去世後請為我舉行聖禮彌撒和禱告」。通篇遺囑中只提到了兩個人的名字，即他的私人秘書斯塔尼斯拉夫.德齊維茨和他在1986年會面的羅馬猶太教寺院的拉賓。

教皇在他出任教皇後的第二年就開始著手寫遺囑。教皇在遺囑中透露，他曾準備在80歲生日或千禧年到來之際退位。遺囑中說：「天意讓我生活在一個困難的世紀，現在這一世紀就要過去了，現在我也將迎來80歲生日，因此我必須問自己，是否現在到了按聖經『西緬支派』章所說的『客我去世』的時間。」他在遺囑終歲說，因為他在1981年遇刺後生還，他決定不考慮退位：「我希望主幫助我認清我要盡責到哪一天，是主安排我於1978年10月16日擔任這一職位的。我請求主在希望我這樣做時，就對我發出召喚。我也希望，只要我存在，就承擔起彼得教宗領導教會的責任，也希望上帝的旨意賜予我擔負這一責任所需要的力量。」(譯者注，遺囑中用是『客我去世』的拉丁語nunc dimittis，大意是：主啊，請讓你的僕人安祥離去，因為我的眼睛已經看到了神聖。)

教皇在遺囑中說：「我沒有留下任何值得擁有的財產。我的日常生活所需要的物品請按適當的方式分發掉。個人的錄音記錄應該燒毀。我希望唐－斯坦尼斯勞(即私人秘書斯塔尼斯拉夫.德齊維茨)來監督執行這些事，我感謝他多年來的合作和善解人意的幫助。」

教皇在遺囑中提到，他曾考慮將波蘭的家鄉作為最後安息的地點，但是明確表示最終的決定要由教廷樞機院來作。

教皇在遺囑中說：「當我的塵世生命越來越接近終點時，我的思想回到了起點，回到了我的父母，我的兄弟和姊姊(我不認識她，她在我出生前就去世了)那裡，回到了瓦德維茨的為我主持洗禮的牧師那裡，回到了我熱愛的城市，那裡有我的同齡故友，小學、中學和大學的同學；我的思想也回到了波蘭被佔時期我做工的日子，回到了我為學生安慰心靈的日子，回到了那一幕和所有的場景，回到了克拉科夫，回到了羅馬，回到了主以特殊的方式託付給我的人們那裡。對於所有的人我只想說一句話：『願上帝獎勵你們』」。

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