本次以台灣經濟的可持續發展為議題的會議旨在讓學者，經濟界人士和政府官員就台灣經濟的中期和長期發展目標提出各種建議。會議未能在涉及與大陸經貿關係的一系列問題上取得一致，如放寬投資大陸限制，兩岸客貨運包機直航以及擴大台資銀行在大陸投資規模等。在此前的分組會上，李登輝領導的台聯黨曾極力反對上述建議。

不過與會者表示，這些提議被收入了會議提案的附錄中。本次會議的提案建議將向內閣匯報並復議。

台灣淡江大學經濟學教授許松根對路透社記者表示，上述議題被歸入「其他建議」這一章節，意味著還有機會在內閣就此進行討論，但他對這些計劃將繼續被追蹤關注並不抱樂觀態度。

這次經濟會議的正式提案令台灣商人感到失望。台商在大陸的投資已達1000億美元，他們希望對兩岸經濟往來的限制能放寬。台灣電子電器製造商協會的副主席羅懷家說，如果政府不對這些提議開綠燈，如開通兩岸貨運直航，那麼政府自己定下的一個目標就很難實現，即把台灣建成本地區的物流中心。

經濟永續發展會議提出的正式建議包括允許大陸遊客到台灣旅遊。但台灣商人一度希望，取消對投資大陸的上限，以及允許台資銀行在大陸開設分行的議題能重新列上會議議程。目前對大陸的投資佔到台資公司總投資額的40％。

儘管台灣與中國大陸之間還沒有實現正常的經貿關係，但中國大陸是台灣最大的貿易夥伴，也是最受台商青睞的投資地點。台灣總統陳水扁周四呼籲台商將投資目光放寬到中國大陸以外，以免形成對中國市場過分的依賴。陳水扁在致開幕詞時說，兩岸經貿不是台灣對外經貿的全部，只是全球佈局的一環，必須放在國際經貿往來的脈絡下，再次確認台灣的發展地位，在投資台灣優先的基本席位下擬定兩岸政策。