物種多樣性不僅僅意味著地球上應該有大象，長頸鹿，大猩猩或者藍鯨等動物，物種多樣性還意味著全世界不能僅有五、六種馬鈴薯的品種，而應該有50種，100種，甚至500種。只有多品種的馬鈴薯才能適應氣候的變化或者病蟲害的侵襲。德國農業部國務秘書海農女士在開幕式的發言中警告說："就像在其它領域一樣，農作物的物種多樣性也受到威脅。如果一個物種消失了，就不可能讓它再現。所以我們要保證不讓動植物絕種。"

在目前農業要求單位高產出的形勢下，卡塔赫納生物安全議定書難以防止物種的減少，但能防止轉基因物種的擴散。目前，一個國家的政府還能夠阻止轉基因種子的流入，但需要有關方面的知識。現在種子公司已經將許多種子帶入市場。但問題是，如果農民買了他們的種子後種植不成功，或者轉基因品種的莊稼毀壞了傳統品種的莊稼，誰負責賠償。

為期一周的波昂卡塔赫納物種安全會議的一個主要議題就是制定明確的賠償規定。巴西籍大會主席馬格諾堅信，所提交的有關草案將在周五獲得通過："在過去的一個月時間裡，許多代表在致力於新規章的制定。我相信他們取得了很大的進展。"

147個卡塔赫納議定書的簽字國為草案提出了上百條的修改建議。綠色和平組織的基因學專家范－阿肯對本周末前能夠制定出賠償規定不抱多大希望。他說："一些國家在那裡攪局，特別是巴西。如果巴西不改變其立場的話，我擔心，最後轉基因工業會得到他們想得到的，即不用為他們所造成的損害賠償。"

目前還有兩點不明朗：其一，出售轉基因種子的公司是否要從他們的營業額中事先拿出一小部分錢來作為賠償基金。一旦出現損失，則用這筆錢賠償。其二："作為個體農民，我如何能夠證明種子是從某一個公司買來的？我必須證明是該公司的錯嗎？如果我必須證明這些的話，那我永遠拿不到賠償。前不久在肯亞就發生了一件這樣的事。一位農民的種子受到污染。可是一个肯亞的小農民如何能夠證明他種子的污染是美國種子公司的疏忽呢？"

美國是賠償規定的最大反對者，但其代表只能坐在會議大廳裡旁聽。因為美國不是保護物種多樣性協議的成員國，因而也不是卡塔赫納生物安全議定書的簽字國。