2019年12月底，微博上流傳著一張武漢市衞生健康委員會的公告，內容首次提到「不明原因肺炎」。 另有一張文件照片顯示，該不明肺炎的檢測結果接近2003年爆發的SARS(非典型肺炎)。 這兩張照片引發廣大民眾討論，眾人皆擔憂SARS疫情重演。2019年12月31日，中國向世界衞生組織報告，該國1100萬人口的武漢市發生多起呼吸性感染病例，病毒來源不明。世界各地疾病專家們迅即啟動了對該病毒真面目的探尋。

12月底湖北武漢市出現的27宗不明原因肺炎，被指均與「華南海鮮市場」有關。 武漢市衞生主管單位在1月1日發出通報，決定對該市場實行休市整治並消毒，通知商戶配合。 一些報導指出，華南海鮮市場不僅販賣海鮮，還有些販賣野味的店鋪。 曾有人自稱在海鮮市場看過家禽、狗、羊或是不知名的動物被關在籠中或是宰殺。

起初，專家們排除了SARS病毒的可能性。2002年，引發致命呼吸性疾病的SARS病毒在中國肆虐，並傳播境外，導致全球範圍近800人喪生。2020年1月7日，中國科學家宣佈，已確認這是一種新型冠狀病毒，類似SARS，屬於冠狀病毒家族，並暫時將它取名為2019-nCoV（2019-新型冠狀病毒），患者症候包括發燒、咳嗽、呼吸困難、肺炎。

武漢市公安局官方微博在1月1日發布消息稱，關於武漢市肺炎疫情的情況，有8名網民在未經核實的情況下散佈謠言，「造成社會不良影響」，已被依法查處。

1月9日，武漢評估專家組表示，武漢不明原因肺炎已經排除了非典型肺炎（SARS）和中東呼吸綜合症（MERS）的可能性。 專家初步判定該病毒為前所未見的新型冠狀病毒，對於其深入瞭解還需要進一步研究。

2020年1月11日，中國公佈了這一冠狀病毒導致的首例死亡病例。死者為一名61歲男子，曾在武漢的那家海鮮市場購物，死於肺炎綜合症。據《明報》報導，該死者為一名61歲男子，因呼吸衰竭、重症肺炎入院，同時患有腹部腫瘤及慢性肝病。 該患者長年在武漢華南海鮮市場採購貨物。 與此同時還有41個確診病例。

之後數天，泰國和日本等國家相繼宣佈曾去過武漢該市場的人員被感染病例。在中國，該市第二個死亡病例被確認。至1月20日，中國國內3人死亡，200多人感染。

1月11日，「武漢肺炎」出現首個死亡案例。 據《明報》報導，該死者為一名61歲男子，因呼吸衰竭、重症肺炎入院，同時患有腹部腫瘤及慢性肝病。 該患者長年在武漢華南海鮮市場採購貨物。 與此同時還有41個確診病例。

1月13日，世界衞生組織(WHO)正式將武漢肺炎命名為「2019新型冠狀病毒」(2019-nCoV)。適逢春節將至，許多人準備搭乘大眾運輸返鄉過年，這也更有可能加速疫情的擴散。

一月中旬，專家們致力於確認該病毒是否會「人傳人」。冠狀病毒具「人畜共通性」，意指可以從動物跳傳至人類。某些冠狀病毒可經由咳嗽或噴嚏傳染。世界各地機場開始對來來自中國的旅客做檢查。1月20日，官方確認，該病毒可在人和人之間直接傳染。

1月20日，習近平、李克強分別對武漢疫情作出批示，要求全力做好防控和救治，與世衛組織和外界保持密切溝通，防止疫情擴散。圖為醫療人員將一名疑似病例送進武漢金銀潭醫院。

1月21日，國家衛健委高級別專家組組長鐘南山在接受央視採訪時，肯定的表示新型冠狀病毒肺炎存在人傳人的現象。他說，在廣東有兩個病例沒有去過武漢，但他們的家人去了武漢後染上了新型冠狀病毒肺炎，因此「現在可以說，肯定有人傳人現象。」當2003年中國爆發嚴重急性呼吸道症候群（SARS）疫情的時後，鐘南山協助揭露疫情的嚴重程度，被譽為「非典功臣」。

在鐘南山之前，中國政府對於新型冠狀病毒是否會人傳人的問題一直都沒有正面回答。到1月20日為止，還是繼續使用「有限人傳人」、「持續人傳人風險低」等說辭。但是在1月22日，國家衛健委召開記者會表示，目前，已經出現人傳人，病毒存在變異可能，疫情存在進一步擴散風險。官員表示，截至21日24時國家衛健委已經收到國內13省(區、市)，累計報告新型冠狀病毒感染的肺炎確診病例440例，死亡9例。圖為武漢天河國際機場的防疫措施。

1月23日，中國對武漢實行「封城」，以試圖遏制該病毒傳播。公共交通暫停。當局指令趕建一家專門收治相關病人的大規模醫院。1月24日，感染人數報告超過830人，死亡26人。當局將「封城」數量增至13個，涉及至少3600萬民眾。

隨著春節將至，武漢作為一個人口聚集地，更多人從武漢往其他國家移動，而加速了疫情的跨國傳播。1月13日，泰國出現首個武漢肺炎的確診病例，之後又新增三例。1月16日，日本出現首個確診病例。20日，一名中國籍女子在韓國確診為該國首個確診病例。21日，一名由武漢搭班機回台的女子確認為台灣首個病例。21日，美國華盛頓州；22日，澳門、香港出現首個確診病例。在感染數量不斷增加的同時，1月23日，世界衞生組織表示，將它宣佈為全球公共健康緊急事件目前「為時尚早」。

1月24日，法國衞生當局確認法國境內發生3例新型冠狀病毒感染病例，標誌著該病毒首現歐洲。數小時後，奧地利報告，一人感染該病毒。

1月25日，中國農歷鼠年大年初一。死亡人數升至41人，全球感染人數超過1300，其中多數在中國。官方取消了眾多大型慶祝安排，以防止病毒擴散。——這一天，數億民眾通常會旅行，或參加各種公共歡慶活動。專家們希望能在3個月內研製出首個冠狀病毒疫苗。