爆炸時，伊斯坦堡最大的一個猶太教堂和距其五公里遠的另一座猶太教堂遭到嚴重破壞。爆炸發生在十點左右，猶太教徒的安息日晨間祈禱期間。大多數受害者是教堂附近的居民。土耳其內政部最初公佈的死亡人數為24人。

以色列政府譴責了對猶太教堂的恐怖襲擊，指出這是一起刑事犯罪活動。據土耳其電視台報導，土耳其的一個激進伊斯蘭組織承認策劃了這起襲擊事件。但是土耳其警方對該組織是否有能力同時進行兩起巨大爆炸襲擊事件表示懷疑。先前，土耳其情報部門曾提醒人們警惕基地恐怖組織在土耳其開展恐怖襲擊活動。

其中一個被炸的猶太教堂早在1986年就遭受過襲擊，當時，疑為是巴勒斯坦人的武裝分子沖進教堂，當場打死了22名正在祈禱的猶太教徒，打傷六人。1992年，該教堂再次受到真主黨民兵的爆炸襲擊，但是沒有造成傷亡。德國外交部表示，爆炸發生後，德國駐土耳其總領事館同土耳其當局建立了密切聯繫。

據土耳其電視台報導，一名不明身份者打電話給土耳其通訊社，宣稱他以伊斯蘭小組的名義進行了此次襲擊，並聲稱將繼續進行襲擊行動，以制止對穆斯林的壓迫。土耳其警方曾經指責該伊斯蘭組織應對2000年12月31日伊斯坦堡市中心的一次襲擊事件負責。當時的爆炸襲擊事件造成十人受傷，至今沒有人承認對該襲擊事件負責。土耳其警方說，今天對兩座猶太教堂的爆炸襲擊使用的都是汽車炸彈。巨大的爆炸力也嚴重損壞了教堂周圍的一些建築，到處是玻璃碎片。一段時間以來，猶太教堂和其它猶太設施一再成為恐怖襲擊的目標。去年四月，突尼斯傑爾巴島上的一座猶太教堂遭到爆炸襲擊，造成21人喪生，其中包括14名德國旅遊者。