陳日君在前往梵蒂岡接受羅馬教皇冊封樞機主教的途中，在德國做了短暫停留。他在接受媒體採訪時，對本篤十六冊封他為樞機主教的背景和動機進行瞭解釋。

香港一向被視為聯接中國和西方的橋樑。陳日君認為，梵蒂岡冊封香港的主教為樞機主教，當然會有政治後果。但是他相信，教皇在這個問題上想的不是政治，而是中國的教會和人民。這才是他的真實目的。

媒體注意到，陳日君在香港為民主、自由和人權仗義直言，且在2003年被評為香港「年度風雲人物」。任命陳日君為樞機主教，有一種挑釁的味道。但陳日君指出，北京政府會對此有政治上的詮釋，他能理解。但是教皇肯定是想通過此舉來促進梵蒂岡與中國的對話。教皇想在與北京的對話中有一個中國的聲音，這個聲音能真正告訴他，問題的關鍵是什麼，背景是什麼。他不認為，他的晉升與他在香港的所作所為有關係。雖然他相信教皇不會反對他在香港產生的影響。在香港，他以天主教的社會教義為行動指南。

對中國天主教愛國會副主席對冊封陳日君的動機感到懷疑一事，陳日君認為這樣的說法很可笑，他已經給予了詳盡的答覆。幸運的是，這位天主教愛國會副主席並不是真正代表中國教會的人物。當然，他有一定的權力。他能控制教會，因為他是政府的一個工具。

陳日君說，中國天主教的兩個互相隔閡的團體之間其實並沒有什麼問題。眾所周知，雙方都忠於教皇。困難在於，雙方之間不能進行接觸，因為政府要控制所有的教會運作。因此，重要的是教皇向兩方面都伸出手，以達到教會統一的目的。中國政府最終將明白，所有的教會都是遵守法律，包括地下教會，因此沒有理由來逮捕地下教會的人。這也是梵蒂岡和北京進行對話的根本前提。

梵蒂岡目前與台灣有外交關係。陳日君說，找到一個解決台灣問題的辦法很重要，否則梵蒂岡就不可能與北京建立外交關係。但是，在此之前，教皇需要有一定的保證。中國必須保障充分的宗教自由。只有這樣，梵蒂岡才能與台灣斷交。沒有這一保證，梵蒂岡不會與北京達成一致。