在前不久北京召開的人大會議上，中國總理溫家寶發表政府工作報告，其中提到台灣的前途要由兩岸人民共同決定。有記者問陳主委對此作何評價。陳明通表示百分之百的不同意：「台灣的未來只能由台灣的兩千三百萬人來決定。如果不是這樣，那麼台灣現在選舉總統，難道也要由13億人來投票嗎？這是民主最基本的道理。至於未來兩岸關係怎麼走，我們可以來談判，提出方案，北京提出一國兩制，我們不同意。我們也提出了方案。討論的結果我們也要交由人民決定。至於他們怎麼辦，是否聽人民的意見，那是他們家的事情。」

陳明通表示願意與北京政府談判，與中共和解，但談判結果也要問台灣老百姓是否同意。他指責北京方面在談判時常常是「把魔鬼藏在細節裡」：「比如大陸觀光客來台灣，大陸非要加上中國大陸居民赴中國台灣旅遊。那我們怎麼能接受呢？因為中國就是中華人民共和國嘛。我們希望把這個架構移除掉，到台灣來就到台灣來玩就好了，干嗎去考慮是國際旅遊還是國內旅遊，就像我當時去中國旅遊，我也沒有想是去國內還是去國外。玩就是玩嘛。Just do it。」

陳明通勸告大陸方面在處理兩岸關係時要寧拙勿巧，不要機關算盡。由觀光客自然談到兩岸直航。陳明通表示，不管誰當選他都對近期內就直航達成一致表示樂觀：「現在進行中的三項議題談判，客運包機，貨運包機，觀光，技術上的問題我們都談完了，都有共識了。但北京不放，是有政治考量。因為現在放了，等於是給了民進黨信譽。他們不願在選舉之前幫民進黨的忙。」

他聲稱，如果他能在陸委會主委的位置上作下去，只需要一年左右的時間就能實現直航。陳明通在批評北京方面有政治考量的同時，也承認目前兩岸交流頻繁，大陸也越來越務實，不一定碰「一中」的話題。

記者會上另一個不斷涉及的話題是公投。陳對公投低調處理。他說，公投只是表達台灣人民加入聯合國的意願，既不是改國號，也不是修憲。如果公投通過，希望國際社會關注北京的一舉一動。不過，照目前形勢看來，公投通過的可能微乎其微。