经过连月来的侦办，台湾前第一家庭涉及的国务机要费案、海外洗钱案等四项弊案侦结，不知是求慎重，还是巧合，特侦组选在12月12日15点15分宣布起诉内容。特侦组主任陈云南表示，陈水扁在总统宣誓就职中曾经宣示，如果有贪赃枉法之行为愿受国法最严厉之制裁，而检方认为陈水扁知法犯法、犯后不断攻讦司法，甚至教唆部属做伪证，毫无悔意，因此建请法院给予最严厉之制裁，并请依贪污治罪条宣告剥夺公权。

对于前第一夫人吴淑珍，检方认为，吴淑珍身为总统夫人，理当辅佐总统，尽心国事，况且长期享受国家最优渥俸给，生活已甚富裕，竟用总统夫人地位，为图夫妻及子女私，巧取公务及私人巨额不法财物，再以人头洗钱隐匿犯罪所得财物，任意指挥政府官员，大肆干政，检方也向法院吁请从重量刑。

此外，一直宣称自己只是被指挥支配对象的陈致中和黄睿靓两人，检方在起诉书中强调两人并未就海外资产进行全面交代，未见悔意，恶性不轻，因此也请求从重量刑。

特侦组终于侦结前总统陈水扁及其家族所涉及的多项弊案，多名国民党立委表示这是还台湾人一个公道。不过对于没有具体求刑的部份，仍有一些国民党立委感到不满。之前经常揭露前第一家庭贪渎情事的立委邱毅认为，公诉检察官并不了解案情，没有特侦组具体求刑的指标，案子可能会拖上十几年，到时就会重案轻判。邱毅甚至直言，这是曾被陈水扁提拔的检察总长陈聪明介入的结果。邱毅说。“重犯轻判的可能性已经很高了，因为陈水扁终归做过8年总统，提拔过陈聪明，所以不能具体求刑。陈水扁在司法界的案桩太多了，这些案桩的黑手我现在才发现超乎我们的想像。”

根据检方的起诉书内容，陈水扁、吴淑珍就上述犯罪之法所得，总计将近台币6亿元。全案共有14名被告，除水扁家4人外，其余10人因为对案情均有详尽供述，检察官请求从轻量刑或免刑。