中国爱国天主教会副会长刘柏年在世界青年节开幕前表示，1995年马尼拉世界青年节期间令人不快的一幕绝不能重演。当时争执焦点是悬挂中国大陆的国旗，还是悬挂台湾的青天白日旗。这位亲北京政府的天主教爱国会副会长强调指出，梵蒂冈必须放弃与台湾的外交关系，承认中华人民共和国是中国的唯一合法政府，二是不要干涉中国内政。只有这样，北京与梵蒂冈的关系才有望改善。

在中国共产党夺取政权、成立中华人民共和国后不久，中国大陆断绝了与梵蒂冈的外交关系。从此以后，中国大陆实际上存在着两个教会组织，其一是受到国家控制的“天主教三自爱国会”，它虽然承认罗马天主教皇为宗教领袖，但拒绝承认他为自己教会的教宗，其主教均由北京政府任命；另一个天主教会组织是亲罗马的“地下教会”，其信徒受到中国国家迫害。尽管没有官方统计数字，但观察员估计，地下教会的成员大约有八百万之多，天主教爱国会的会员人数为530万。

北京政府表示，只要梵蒂冈不断绝与台湾的外交关系，梵蒂冈与北京之间就不存在恢复外交关系的可能性。数年前，梵蒂冈就明确表示，愿意与北京政府在建交问题上寻求一致。然而，在本笃十六世当选罗马天主教新教皇之后，中国大陆与梵蒂冈的关系似乎朝着这个方向迈出了新的步伐，在第二个争执点上也有所进展：梵蒂冈认为，唯有梵蒂冈有任命主教的权利。而北京政府则因担心发生诸如东欧所经历的政治教会运动，坚持对所有国内的宗教组织实行监控，并要求在任命主教时拥有共同决策权。6月初，梵蒂冈与北京政府意外地就任命上海新的辅理主教约瑟夫邢文之达成一致。一个月之后，梵蒂冈与北京政府经协商之后，又在西安任命了一位新主教。

香港教区主教陈日君表示，这是一大进步。他说：“由梵蒂冈任命了两名中国主教并获得了北京政府的认可的确是件可喜的事情。更为重要的是：任命主教一事完全公开，过去则不然，尽管梵蒂冈任命了主教，但外界却一无所知。我认为，这是一个进步。”同时，香港教区主教陈日君也指出，中国的天主教会一直受到严格的监控，许多信徒受到迫害。北京政府担心，中国大陆会出现由国外操控的群众运动，例如受到国外支持的法轮功组织等。香港教区主教陈日君认为，即便是新当选的本笃十六世也无法改变这一现状。所以，他对发生根本性的变化并不很乐观，因为“北京政府官员不会轻易放弃手中的权利。”

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