欧盟和非洲联盟在最近的一次高级会晤时就一些重要议题上仍然存有重大分歧。周二晚，欧盟与非洲联盟公布了一份闭幕文件。此前，非洲方面批评欧方计划的对非洲高级人才简化入境手续事宜。他们认为，这样做，会导致专业人才从非洲流失，而恰恰是非洲特别急需专业人才。不过，欧盟方面做出承诺，他们将制定有关的政策法律，让以上提高的风险不致出现。此外，欧非双方还在国际法解释上意见不同。非洲联盟担心，国际法庭因战争罪以及反人性罪法律追究，会对一个国家的主权产生质疑。他们提出避免滥用该法的警告。但欧洲方面则一再强调，所犯罪行不能不受惩罚。

另外，欧盟同非洲联盟计划最迟2009年签署经济伙伴协定。双方就此议题进行了长时间谈判。法国发展部国务秘书承认，欧盟方面如果想让谈判进展顺利，就必须在对非洲的发展政策领域做出更大的改善。许多非洲国家激烈批评这一经济伙伴协定，因为担心一旦对欧洲的产品和服务开放市场，不能从中得到任何经济实惠。