今年三月台湾在野党国民党主席马英九风光访问美国，获得美方高规格接待，让执政的民进党备感压力。民进党政府本想藉著陈水扁总统此次出访中南美洲友邦时过境美国的机会，和马英九别苗头，不料行程规划，一波三折。基于外交处境的考虑，台湾驻美代表处是在中国国家主席胡锦涛结束访美行程后，才向美方提出申请，希望能让陈水扁在纽约或旧金山过境，美方却迟迟没有答应，而且还另外建议安克拉志为过境地点。

由于过境地点始终无法敲定，出访行程因而延后一天，虽然5月3日台湾外交部长黄志芳表示，台湾能体谅美方的考量，陈水扁总统往返都将过境安克拉志。但最后陈水扁还是不满过境美国的安排，决定不照原计画过境，他在出发前批评这都是中共打压台湾的结果。

对于陈水扁总统出访前，质疑这次过境美国不顺的原因，是中国和国民党作梗，马英九意在言外的说，全国人民都应该知道是什么原因，不要把责任都推到外交系统。

台湾元首出访，行程却成谜，曾经担任过外交部长的国民党立委蒋孝严说，这是陈水扁操作终统议题的结果，却让全体台湾人民蒙羞。

面对泛蓝方面的批评，泛绿方面自然是全力护航，民进党立委陈景峻说，外界不该再对此事冷嘲热讽。他说，大家好像在以幸灾乐祸的心情看待国家元首的出访。

陈水扁临时决定不过境美国，美方只表示这是台湾的决定，这样的反应似乎也透漏几许无奈，而陈水扁反将美国一军的做法，是否会影响美台关系，外交部长黄志芳说，应该不会。他说，台美关系的基本点仍然非常好，双方有非常坚实共同的利益。这次的确是特定时空之下所做的特定安排。

已退休的台湾资深外交官陆以正表示，民进党该觉醒，不要再用过境美国的手法拉抬自己的声势。他说，所谓过境外交，就是公关小组的人到旅馆里去看看他，这样就很得意，回来说在外头拼了外交了。美国看透了这一套。这次终统完全不听美国的，所以美国也让你看一看，如果美国不睬你，你会有多惨。

陈水扁预计在结束哥斯大黎加的访问之后，将在9日启程返国，回程会在哪哩过境，目前还是个谜。