2004年及2005年发生在马德里和伦敦的恐怖袭击事件表明，欧盟国家也是基地恐怖组织的袭击目标。为了消除这一危险，欧盟在2005年做出了四点反恐战略规划，即堵死人们转向恐怖主义的道路；加大惩罚恐怖分子的力度；保卫边境及交通要道以及援助遭受重大恐怖袭击的国家。在扩大恐怖组织方面，互联网所起的作用越来越大。因此欧盟准备加强对互联网的控制。欧盟反恐合作协调员克尔乔夫指出：

"目前在互联网中有大约5000个煽动暴力和恐怖活动的网页。因此我们是否能够采用合法的手段来控制这些网页就显得非常重要。我们也应该制定相应的反措施。不能仅仅采取镇压手段，而是还要采取预防措施。我们必须向穆斯林解释，恐怖活动的最大受害者实际上就是他们自己。这是一场思想战线的斗争。我们必须防止恐怖组织滥用伊斯兰宗教的名义进行恐怖活动。"

欧盟在2002年5月制定了一个恐怖嫌疑组织及恐怖嫌疑人的名单。被列入黑名单的人则被监控起来。他们的旅行自由被剥夺，银行的帐户被冻结，财产被没收。而且一旦上了黑名单就几乎没有再被划掉的可能。很多人根本不清楚为什么自己上了黑名单。他们也得不到为自己辩解的机会。现在有人对这个黑名单提出了质疑。国际法庭也接到了许多诉讼状，并且在三个案件中判控方胜诉。克尔乔夫指出，尽管欧盟委员会到目前为止还没有修改名单，知情权政策得到了改善。他说："我们通知那些上了名单上的人，尽可能给他们解释其中的原因。他们也可以用法律手段来为自己辩护。"

在围剿恐怖分子的斗争中，欧盟警察局和欧盟司法局起到了非常重要的作用。这两个机构负责协调欧盟各成员国之间的反恐斗争。克尔乔夫指出，欧盟各国间的反恐合作已经取得了很大的成果。在反恐斗争中各自为政是难以奏效的，必须进行更加紧密的合作。他进一步指出："现在的反恐合作已经比五年前有了长足的进步。我们在最近一段时间里多次地阻止了恐怖袭击的发生，比如恐怖分子在巴塞罗纳，丹麦，德国及比利时的恐怖袭击计划都被及早地发觉。这主要归功于情报机构和警察机构的良好合作。但我们的合作工作还有很大的改善空间。"

克尔乔夫强调说，在情报共享方面还需改善。恐怖主义是全球性问题，因此也只能在全球合作的基础上得到解决。