执政的民进党在选举中惨败，只拿下六个县市，甚至输掉了执政十六年的台湾第一大县台北县。民进党胜选的六个县市全部在台湾南部，其中陈水扁的老巢台南县虽然得以保住，但只以七千多票险胜国民党。本应是民进党票营的台湾县、宜兰县和嘉义市也悉数由绿变蓝，而且国民党是高票数差距胜选。

选举前，台湾的县市长中，民进党占十席，中国国民党占八席，亲民党占二席，新党占一席，无党籍二席；选举后，在总共二十三席县市长中，中国国民党获得十四席的过半席次，民进党得六席，亲民党得一席，新党得一席，无党籍得一席。

这一次台湾地方选举结果将对台湾政治格局产生重大影响。对于执政的民进党来说，这次选举就是一次执政中期的民意测验，选举失败意味着陈水扁被选民亮了张黄牌。对于国民党来说，这次选举就是2008年大选的预演，而大胜的结果不但鼓舞了国民党的士气，两年后台湾总统叫马英九的可能性也越来越大。

本次地方选举的选战虽然没有到“枪响”的程度，但激烈程度绝不亚于2004年总统选举。选举之前，今年八月刚出任国民党主席的马英九放下豪赌狂言，不拿下过半县市就辞职，而民进党主席苏贞昌也发誓若失去台北县就辞职。选举揭晓后，苏贞昌履行诺言，辞去了民进党主席一职。

分析家认为，民进党惨败的原因是去年总统选举的“枪击案”仍让选民心存芥蒂，陈水扁再度执政后政绩乏善可陈，经济衰退，两岸关系上陷入被动从而多少失去了靠“台独”赢得选民的资本。本次地方选举前的选战较量中，民进党爆出高雄捷运舞弊案，这也是民进党在选民中失分的一个重要因素。