“这个海岛面临巨大的挑战，需要和解。它要处理好与具有威胁性的中国的关系、改革有缺陷的政治机构、重新振兴经济，但现在获得的却是新的愤怒和动荡。选举之日并非战役结束之日，而是一场新战役的开始之时。无论法院如何裁决选举结果，可以肯定地是，与四年前相比，陈水扁与他的民进党有了巨大的增长。不幸的是，他的成就更多是靠思想意识动员、而不是靠实际政策取得的。”

在评论台湾公投失败对两岸关系的影响时，法兰克福汇报写道：

“保守的国民党不支持公投，这是肯定的。但是陈水扁不只受到反对党、同时也受到自己阵营中的一部分人的牵制。台湾人认为，以公投向中国挑衅，显然太危险，许多人认为没有必要。台湾年轻的民主做出了自主和有区别的抉择：选民使陈水扁第二次当选，但却没有为他的政策开出通行证。

北京将利用这次失败的公投为自己的政策服务，但在今后四年内，北京想继续无视台湾总统就很困难了。所谓的捣乱分子再次当选，想必使中国政府看到，台湾正在日益离大陆远去。在北京看来，连战无疑是合适的人选，但即使连战当总统，台湾也不会屈服于北京毫不妥协的‘一个中国’政策，再说国民党也有了变化。台湾的大陆政策波动于保持现状和独立之间，连战与陈水扁的区别更多在于风格，而并非在于原则。”

“台湾总统的胜利与失败”是新苏黎世报一篇评论的题目。评论也认为绿营与蓝营这次打了个平手：

“如果说国民党没有能赢得总统大选，那么它至少成功地推翻了公投，在这个领域打败了陈水扁。如此看来，选举取得了互为平衡的结果。台湾人选了陈水扁，但却没有足够的人数参加公投。这样的结果向外界发出了两个在一定程度上不相上下、不同的政治信号：台湾以陈水扁的再次当选强调了自己的独特的身份，这样的身份与北京‘一个中国’的教条绝不相容。而公投不成功则表明，人们对形式上宣布独立持很大保留态度。即使台湾总统对独立旗帜鲜明，台湾人现在仍然要保持政治现状。”