在台湾国民党派团前往北京商谈台商春节包机直航的同时，鲜为人知的是，由台湾政府授权的台湾民航业者正在澳门就同一议题与大陆方面的民航部门进行商谈。台湾智库国际事务部主任赖怡忠认为，国民党这一次主动上门与大陆谈包机直航是看准了争取民心的政治机会，陈水扁政府对此报着乐观其成的态度，但是赖怡忠说：

“国民党并没有得到台湾政府的授权，至于国台办的陈云林先生提到这是国内航线，我想关键的问题是这只是国民党单方面主动去谈，并不代表台湾政府。以我的了解，台湾方面主管两岸直航的陆委会将首先根据两民航业者在澳门谈的结果来进行判断。”

赖怡忠认为，陈水扁政府不会接受北京方面有关“国内航线“的提法，但台湾也不会将台商包机直航称作“国际航线”，以免激怒北京：“台湾的看法一直是把它当作跨岸航线，所以也不是将其作为国际航线。”

从北京的角度讲，在国台办与国民党就包机直航的问题会谈后，球已经被踢到了陈水扁一方，关键是看陈水扁政府做出怎样的反应。国台办主任陈云林表示，“如果台湾当局真正顾及广大台湾同胞的利益，言而有信，采取灵活，务实的做法，这次台商春节包机完全可以实现。”

台湾大学政治系教授杨永明认为，在包机直航的问题上，两岸都应该采取灵活的态度：“我认为不一定是要见诸文字或者让对方完全接受，可以采取象以前说的各自表述的方式。不一定在事物性的问题上也要扣上政治的帽子，否则会造成实际问题没有办法去处理的局面。“

分析家认为，尽管时间紧迫，以双向，双飞，不中停的方式实现２００５年台商春季包机直航仍然非常有希望。杨永明说：

“在有实际需要，过去也做过的情况下，如果今年做不到，那其实表明今年两岸关系走向更加对立的方向，这是北京和台湾都不希望看到的。北京现在正在制定‘反分裂国家法’，如果两岸包机直航都没有办法，似乎会让整个国际社会和台湾人民感到北京采取的政策越来越对立，越来越强硬。这对北京整体或长期的对台政策是不利的。

对台北来说，陈水扁在立法院选举中受挫，这一次国民党站出来又让陈水扁政府觉得被抢了光彩，但是如果不接受谈判结果，造成包机直航没有办法实现，那更显出陈水扁政府没有办法处理民间实际需要的问题，更会给人民留下他无能处理两岸政策的观感。所以我想陈水扁是会接受的，但可能会透过其他民间机构再去确认，或者作进一步的沟通。”