抽签由国际足联新闻部主任马尔库斯.奇格勒主持。一代德国足球名将、1990年代表德国队夺得世界杯的马特乌斯、球王贝利、荷兰足坛传奇人物克鲁伊夫、喀麦隆足球英雄米拉负责从除了塞黑的四个挡中抽取球队，而法国98年世界杯冠军主力卡雷姆布、南非(下届世界杯东道主)球星拉德贝、日本球星中山雅史和美国球星科比.琼斯负责抽取各队在小组中的编号。抽签结果是(各组第一名为种子队)：

A组：德国、哥斯达黎加、波兰、厄瓜多尔

B组：英格兰、巴拉圭、特立尼达和多巴哥、瑞典

C组：阿根廷、科特迪瓦、塞黑、荷兰

D组：墨西哥、伊朗、安哥拉、葡萄牙

E组：意大利、加纳、美国、捷克

F组：巴西、克罗地亚、澳大利亚、日本

G组：法国、瑞士、韩国、多哥

H组：西班牙、乌克兰、突尼斯、沙特

对于荷兰人和阿根廷人来说，贝利除了是“乌鸦嘴”，现在还应该是“乌鸦爪”了，因为贝利把荷兰给抓进了阿根廷的C组。对于塞黑人来说，作为当晚主持人的德国超级名模克鲁姆大概是最“面目可憎”的了，因为她的纤纤玉手把塞黑人送进了C组。这样，C组无疑将是本届世界杯中最凶险的一组了。

意大利与捷克、美国、加纳同为E组，无疑是凶险程度仅次于C组的第二个“死亡之组”了。有趣的是，英格兰主帅埃里克森遭遇祖国瑞典，而日本主帅济科则同样要与祖国巴西为敌。

东道主德国与上届冠军巴西都如愿各自与实力不是很强的队伍分在一组。德国队主教练克林斯曼说，德国的分组本来会运气更差，因此他对现在的分组非常满意，认为小组赛将是可以解决任务。6月9日，德国将与哥斯达黎加对阵慕尼黑安联体育场，揭开2006世界杯的序幕。

德国电视一台上担任评论的君特.内策尔说，德国在世界杯分组上一向十分运气，这次分到了一个对手很弱的组，与德国同组的厄瓜多尔虽然有过预选赛上战胜巴西和阿根廷的战绩，但那是在主场高原气候下进行的，而根据他的经验，这样的球队在“下山”后就一般没有什么作为了。

国际足联新闻部主任齐格尔主持了抽签仪式。齐格尔介绍了抽签规则与程序：国际足联将32支球队分为4档。阿根廷、巴西、英国、法国、德国、意大利、墨西哥和法国被确定为种子队。第2档为安哥拉、科特迪瓦、加纳、多哥、突尼斯、厄瓜多尔、巴拉圭、澳大利亚；第3档为克罗地亚、捷克、荷兰、波兰、葡萄牙、瑞典、瑞士和乌克兰；第4档为伊朗、日本、沙特阿拉伯、哥斯达黎加、美国、韩国、特立尼达德和多巴哥。塞黑为特别档。

抽签原则是最多只能2支欧洲球队同组，其它大洲球队则不能同组。因此，被列到特别档的塞黑只能与巴西、阿根廷或墨西哥同组。德国预先分到A1位，巴西则分到F1位。这保证两队能在德国最大的3个球场比赛，两队如以头名小组出线，那么只有到决赛才能相遇。

全世界三亿五千万球迷通过电视屏息观看了抽签的全部过程。短短的三十几分钟里，世界的焦点聚集到了莱比锡。来自世界各地的6000多名代表和嘉宾聚集莱比锡新会展中心一号大厅出席了抽签仪式，几乎每一个国家都派出了新闻记者进行现场报道，世界杯组委会说现场有2000多名记者，其中有160多个电视实况转播队伍。

整个晚上也是一个世界足球的典礼，世界足坛的风云人物聚集抽签会场。东道主准备了盛大的伴随节目，其中最有名的歌星是12次获得拉丁歌手格莱米大奖的胡安内斯。被誉为世界手眼最快的魔术师汉斯.克鲁克现场进行了梦幻魔术表演。晚会还播放了德国著名导演沃尔夫刚.贝克尔专门为世界杯编导的选出东道主德国的短片“世界都到朋友家作客”。