法兰克福汇报写道，“按国际惯例，当事潜艇必须浮出水面，并升旗表明国籍。日海军竟让该潜艇逍遥而去，很可能是东京政府深思熟虑之为。数月以来，日中之间气氛不合，原因之一是小泉首相再度参拜靖国神社。该神社供奉的不仅是战争中的日本死难者，也有遭到审判和处决的日本战犯亡灵。自2001年10月小泉就任首相一年半后首次访问北京以后，两国政府首脑之间就不再有双边交往了。”

‘法兰克福汇报’继续写道：“现在，小泉把抗议作为一个小小的平衡手段。这位日本政府领导人上周五晚上表示，潜艇事件令人非常遗憾，但鉴于日中关系的重要性，两国应寻求相互理解，减少此次事件的影响。为此，日方仅将中国驻日公使召到外交部，提出委婉抗议。

“除潜艇事件和小泉对历史缺乏敏感性外，构成日中双边关系负担的还有两国对东海上几个岛屿主权的争议。这些岛屿日方称之为尖阁列岛，其中一个中方称为钓鱼岛，距此次潜艇被发现水域西北约200公里。引起争议的也包括两国专属经济区之间的一块油气田。中方计划开采这一油气资源。

‘法兰克福汇报’最后总结说：“鉴于亚太地区智利峰会召开在即，日中双方目前正在就峰会期间举行两国领导人双边会晤的可行性进行评估。虽然日本政府此次因为潜艇事件而不得不在军事上有所表示，并且5年来首次下令海军进入戒备状态，但她显然想保留双边会晤这一机会。”