台湾反对党民进党主席蔡英文表示，马英九总统所提出的与大陆签署和平协议的考量将有损于台湾的主权。蔡英文周三在一份回应马英九有关讲话的声明中，再次指责马英九此刻抛出两岸和平协议，将使台湾人民面临四个危险，包括牺牲台湾主权、改变台海现状、危及民主价值以及破坏战略纵深。 周一，马英九表示，在国家需要、民意支持和国会监督的前提下，未来10年内不排除与中国大陆签订两岸和平协议。反对党阵营连日来对此展开强烈批评，民进党认为“两岸和平协议”就是“统一时间表”。